Žarnyno skausmas dažniausiai atsiranda dėl ligos, sveikatos būklės ar traumos, kuri paveikia pilvo organus. Nors skausmas gali kilti tiesiai iš plonosios arba storosios žarnos, sunku pasakyti, ar skausmas tikrai yra žarnyno, ar jis kyla iš kitų organų ar pilvo sričių. Dažniausios žarnyno skausmo priežastys yra uždegimas, žarnyno nepraeinamumas, virškinimo sutrikimai, dujų susidarymas ir opos.
Kai dėl ligos ar sužalojimo pilvo srityje patinsta organas ar kiti audiniai, tai dažnai sukelia skausmą šalia žarnyno. Skausmas dėl uždegimo dažnai prasideda staiga ir gali būti nuolatinis arba periodiškas. Kai kurios uždegiminės ligos, tokios kaip apendicitas, yra rimtos ir reikalauja skubios medicinos pagalbos. Kiti, tokie kaip divertikulitas, aplink gaubtinę žarną esančių audinių patinimas, paprastai sukelia tik nedidelį skausmą ir nereikalauja jokio gydymo.
Žarnyno užsikimšimas yra viena iš labiausiai paplitusių žarnyno skausmo priežasčių, kurios iš tikrųjų atsiranda žarnyne. Tulžies akmenys gali užkimšti tulžies lataką, o tai užkemša žarnyną ir sukelia skausmą. Plonosios žarnos arba storosios žarnos užsikimšimas gali trukdyti skysčiui patekti per žarnyną ir sukelti skausmą. Šiuos užsikimšimus dažniausiai sukelia išvaržos, paveiktos išmatos arba pluoštinio audinio juostos, susidarančios pilvo srityje, nors kartais taip pat yra navikai.
Kai kurie žarnyno užsikimšimai išnyksta savaime geriant skysčius ir laikantis mažai skaidulų turinčios dietos. Gali tekti chirurginiu būdu pašalinti rimtesnes kliūtis. Negydomi užsikimšimai gali sukelti žarnyno dalių mirtį, o bet koks negyvas audinys taip pat gali būti pašalintas operacijos metu, siekiant pašalinti obstrukciją.
Nevirškinimas ir dujų susidarymas yra vienos iš dažniausiai pasitaikančių pilvo skausmo ir diskomforto, atsirandančio žarnyno srityje, priežasčių. Nevirškinimas dažnai yra pagrindinės būklės, tokios kaip dirgliosios žarnos sindromas, gastroezofaginio refliukso liga ar opos, požymis. Dujos, atsirandančios prarijus oro perteklių arba bakterijas storojoje žarnoje, kurios virškina maistą, taip pat gali sukelti žarnyno skausmą. Dujoms paprastai nereikia medicininio gydymo, nors nuolatinės dujų problemos gali būti žarnyno problemos ar sutrikimo požymis.
Opos yra mažos opos skrandyje arba plonojoje žarnoje. Jie gali sukelti pilvo skausmą ir spaudimą, kuris gali būti jaučiamas žarnyne arba šalia jo. Nors bet kas gali susirgti opomis, kurios sukelia žarnyno skausmą, žmonės, kurie rūko, reguliariai geria alkoholį, yra 50 metų ir vyresni arba reguliariai vartoja nesteroidinius vaistus nuo uždegimo, labiau linkę susirgti opomis. Daugelis opų išnyksta savaime, o dauguma jų išnyksta vartojant vaistus, mažinančius rūgšties kiekį skrandyje.