Pagrindinė nepaaiškinamo karščiavimo priežastis yra tam tikros rūšies bakterinė ar virusinė infekcija. Kitos priežastys yra receptiniai vaistai ir rimtesnės pagrindinės ligos, tokios kaip ŽIV arba vėžys. Nepaaiškinamas karščiavimas gali lydėti kitų simptomų, panašių į peršalimą ar alerginę reakciją. Šie karščiavimo tipai paprastai yra žemo laipsnio ir gali pasireikšti vieną kartą, su pertraukomis arba chroniškai.
Asmenys gali karščiuoti, kai įgyja viršutinių ar apatinių kvėpavimo takų infekciją. Karščiavimas gali būti nedidelis ir tik keliais laipsniais pakelti normalią žmogaus kūno temperatūrą. Be karščiavimo, kvėpavimo takų infekcijas gali atpažinti ir kiti simptomai, pvz., skysčių perteklius ir gleivės krūtinėje, gerklėje, nosyje ir ausyse.
Nepaaiškinamas karščiavimas dažnai yra imuninis atsakas, skirtas padėti organizmui palaikyti tinkamą temperatūrą. Bakterinės infekcijos, atsirandančios organizmo organuose, įskaitant tokias ligas kaip dubens uždegiminė liga, gali sukelti karščiavimą. Nors šios bakterinės infekcijos gali būti gydomos antibiotikais, jos gali nesukelti jokių akivaizdžių simptomų arba gali praeiti šiek tiek laiko, kol pasirodys pastebimi simptomai.
Sunkios ligos, kurios pažeidžia imuninę sistemą, gali sukelti lėtinę nepaaiškinamą karščiavimą. Viena iš šių ligų yra ŽIV arba AIDS. Kadangi ši būklė pamažu atakuoja organizmo imuninę sistemą ir atima jos galimybes, karščiavimas išsivysto kaip bergždžias organizmo bandymas atsikratyti viruso. Bet koks vėžio tipas taip pat gali sukelti nuolatinį karščiavimą.
Paslaptingos karščiavimas yra gana dažnas vaikams ir kūdikiams, nes jų sistemos prisitaiko prie supančios aplinkos. Kai vystosi vaikų imuninė sistema, jie labiau linkę pasigauti įvairių virusų nuo kitų vaikų. Išskyrus atvejus, kai karščiavimas yra santykinai didelis, jo paprastai nereikia atskirai gydyti ir jis išnyks, kai tik bus gydoma infekcija.
Tam tikri receptų tipai ir narkotikų vartojimas gali sukelti karščiavimą. Steroidai ir vėžio gydymas gali sukelti organizmo uždegiminį atsaką, dėl kurio atsiranda karščiavimas. Net per didelis alkoholio ir nelegalių narkotikų vartojimas gali sukelti nuolatinį karščiavimą, kuris neturi papildomų simptomų. Kai kurios ligos, kurios išsivysto dėl piktnaudžiavimo alkoholiu, pavyzdžiui, kepenų pažeidimas ir randai, gali būti tikroji pagrindinė karščiavimo priežastis.
Tiek vaikai, tiek suaugusieji gali karščiuoti be priežasties. Įprasta priežastis yra pagrindinė būklė, kuri tam tikru būdu susilpnina imuninę sistemą. Tam tikros lėtinės ligos, įskaitant diabetą ir vilkligę, gali sukelti nuolatinį karščiavimą.