Pailgosios smegenys kartu su apatine alyvmedžio dalimi, piramidėmis ir tiltu sudaro smegenų sritį, vadinamą smegenų kamienu. Ši sritis yra atsakinga už autonominės nervų sistemos procesus, kurie kontroliuoja širdies ritmą, kvėpavimą, skausmo jautrumą, vėmimą ir vazomotorinius refleksus. Smegenų kamieno dalis, jungianti tiltinį tiltą su nugaros smegenimis, pailgąsias smegenis būtų lengva supainioti su stuburo audiniu, jei jos šonuose nebūtų skirtingų piramidinių struktūrų. Pailgąsias smegenis daugiausia sudaro baltoji ir pilkoji medžiaga; jame taip pat yra komunikacijos takai, pernešantys pranešimus tarp pusrutulių, taip pat tarp smegenų ir nugaros smegenų. Atsižvelgiant į tai, kad visos konstrukcijos ilgis yra mažesnis nei 1.2 colio (3 cm), daugumos mikroskopinių elementų atskiros funkcijos nėra gerai suprantamos.
Per visą viršutinę pailgųjų smegenėlių pusę eina lankiniai pluoštai. Jie randami tiek giliai smegenyse, tiek jos paviršiuje. Labiausiai paplitusios giliausios skaidulos, jungiančios funiculus gracilis, funiculus cuneatus ir restiforminio kūno branduolius su raphe.
Rafas randamas tiesiai virš piramidžių, pailgųjų smegenėlių centre. Jį sudaro tankus neuronų ir nervinių skaidulų mišinys. Jo skaidulos tęsiasi daugybe krypčių, kai kurios iš jų jungiasi su ketvirtojo skilvelio dugnu.
Kartais laikomas žemiausia tilto dalimi, ketvirtasis skilvelis taip pat gali būti laikomas aukščiausia pailgųjų smegenų dalimi. Jame randamas hipoglosinis branduolys ir dviprasmiškas branduolys, taip pat ir hipoglosinių, ir glossopharyngeal papildomų nervų kilmės vieta. Ši rombo formos konstrukcija turi ir grindis, ir stogą. Stogą sudaro medulinė vela, o grindis sudaro rombinė duobė ir formatio reticularis.
Formiatio reticularis yra neįprasta struktūra, randama už alyvmedžio ir piramidžių. Jį sudaro nervinių skaidulų pluoštai, išdėstyti 90 laipsnių kampu vienas kito atžvilgiu. Jie jungiasi su alyvmedžiu, nugaros smegenimis, funiculus cuneatus ir funiculus gracilis.
Pilka medžiaga randama visoje šoninėje medulla dalyje. Jame yra daug gyvybiškai svarbių branduolių, kurie naudojami jutiminei informacijai iš periferinės nervų sistemos perduoti. Pilkojoje medžiagoje taip pat yra daug kaukolės nervų.