Jungtinių Valstijų Aukščiausiasis Teismas, aukščiausias vyriausybės teismų sistemos teismas, nagrinėja svarbias bylas ir priima sprendimus dėl įstatymų konstitucingumo. Amerikos vyriausybės istorijoje buvo keletas prieštaringų JAV Aukščiausiojo Teismo bylų, kurios turėjo ilgalaikį poveikį politikai, teisei, kultūrai ir vyriausybei.
Viena kontroversiškiausių JAV Aukščiausiojo Teismo bylų Amerikos istorijoje yra Marbury prieš Madisoną (1803), kuri paskelbė Kongreso aktą prieštaraujančiu Konstitucijai. Williamas Marbury, kuriam prezidentas Johnas Adamsas norėjo užimti Kolumbijos apygardos taikos teisėjo pareigas, negavo šios komisijos pagal naująją Džefersono administraciją ir padavė į teismą valstybės sekretorių Jamesą Madisoną, remdamasis 1789 m. Teismų įstatymu. Teismas nustatė, kad nors Marbury turėjo teisę pretenduoti į savo postą, 1789 m. Teismų įstatymas tiesiogiai prieštarauja trečiajam JAV Konstitucijos straipsniui, apibrėžiančiam teismų jurisdikciją. Ši byla buvo ir yra prieštaringa Amerikos politikoje, nes teismas nusprendė, kad konstitucija turi viršenybę prieš įstatymų leidybos veiksmus.
Dar viena iš svarbių prieštaringų JAV Aukščiausiojo Teismo bylų yra Dredas Scottas prieš Sandfordą, kurį teismas nusprendė 1857 m. Išlaisvintas vergas Dredas Scottas po savo šeimininko mirties buvo perkeltas į vergiją palaikančią valstybę. Jis padavė ieškinį, teigdamas, kad kadangi anksčiau gyveno valstybėje, kurioje vergija buvo neteisėta, jis turėtų būti laisvas. Teismas nustatė, kad Dredas Scottas neturėjo piliečio teisių, o juodaodžiai nebuvo laikomi piliečiais. Tai buvo karštai diskutuojama problema, nes per tą laiką šalį suskaldė vergovės problema ir ji atsidūrė ant pilietinio karo slenksčio.
Priėmus 13-ąją pataisą, uždraudusią vergiją Jungtinėse Valstijose, Kongresas priėmė 14-ąją pataisą, kuri vienodai apsaugojo piliečius pagal įstatymą. Tačiau daugelis atskyrimo atvejų vis dar egzistavo visoje JAV Vienas iš pavyzdžių buvo Luizianos Atskirų automobilių įstatymas, pagal kurį geležinkelių bendrovės savo keleiviams turėtų suteikti „atskiras, bet lygias“ patalpas. 1892 m. birželį afroamerikietis Homeras Plessy keliavo „tik baltųjų“ traukinio vagonu. Jis buvo suimtas ir jo byla galiausiai tapo viena kontroversiškiausių JAV Aukščiausiojo Teismo bylų Amerikoje. Teismas jį pripažino kaltu 1896 m., taip sukurdamas precedentą, kad jeigu būtų suteiktos „atskiros, bet lygios“ patalpos, jos buvo saugomos pagal Konstituciją.
1954 m. Brown prieš Švietimo tarybą sprendimas tikriausiai yra labiausiai žinoma Amerikos teisinė byla ir neabejotinai viena kontroversiškiausių JAV Aukščiausiojo Teismo bylų istorijoje. Nors Plessy prieš Fergusoną nustatė atskiras, bet lygias patalpas, kurios turi būti saugomos pagal konstitucinę teisę, Brown byloje Aukščiausiasis Teismas nustatė, kad valstybės, teikiančios atskiras mokymosi patalpas moksleiviams, atsižvelgiant į rasę, pažeidė 14-ąją pataisą, taip integruodamos mokyklas visame pasaulyje. šalį ir atveria duris prieštaringai vertinamam pilietinių teisių judėjimui.
14-oji pataisa taip pat suvaidino svarbų vaidmenį 1973 m. Roe prieš Wade byloje. Du advokatai Teksaso moters (žinomos kaip Roe) vardu teigė, kad moteris turi pagrindinę teisę į abortą. Teisėjai vienoje iš prieštaringiausių JAV Aukščiausiojo Teismo bylų nusprendė ieškovui palankiai, tokiu būdu panaikindami valstijos įstatymus. Jie padarė išvadą, kad 14-oji Konstitucijos pataisa suteikė teisę į privatumą pagal tinkamo proceso išlygą, todėl abortai Jungtinėse Valstijose tapo legalūs. Šis klausimas Amerikoje vis dar labai diskutuojamas ir šiandien, todėl teismo sprendimas yra Amerikos istorijos orientyras.