Aviečių augalus gali paveikti įvairios ligos, įskaitant įvairių rūšių marias, cukranendrių botritą, antracnozę, lapų garbanes, mozaikos ligą ir venų chlorozę. Kai kurias iš šių aviečių ligų sukelia invazinis grybelis, o kitos yra virusinės. Ekspertai rekomenduoja pirkti augalus, kurie yra sertifikuoti kaip be virusų, nes aviečių augalas yra ypač jautrus virusinėms ligoms.
Daugelis aviečių ligų atsiranda dėl grybelio, kuris neigiamai veikia tam tikras augalo sritis. Sergant cukranendrių maru, grybelis patenka į šakos žaizdos vietą, kurią galėjo sukelti vabzdžių pažeidimai, genėjimas ar sužalojimas persodinimo metu. Ši liga dažniausiai pastebima juodosiose avietėse. Nendrių botritas pažeidžia seniausius augalo lapus su rudomis dėmėmis arba pilkšvais dryželiais. Pažengusiose stadijose augale atsiras tamsių į pūsleles panašių opų. Antraknozė sukelia purpurines arba raudonas dėmes ant aviečių augalo lapų, šakų, stiebų ar vaisių.
Aviečių augalo šakeles ir lapus pažeidžiantis spurtas dažniausiai prasideda lapų pakraščių infekcija, kuri plinta į vidų. Ši būklė dažniau pasitaiko raudonoms avietėms ir gali užkirsti kelią pumpurų žydėjimui. Vidurių maras turi dvejopą priežastį, nes ligą sukeliančiam grybeliui į augalą leidžiama patekti per pažeistus audinius, kuriuos sukelia dygliakrūvio lervos. Tai viena iš aviečių ligų, galinčių pakenkti augalui. Lapų dėmėtumą liudija juodai žalios dėmės arba skylutės augalo lapuose – būklę galima sumažinti tinkamai genint arba naudojant fungicidą.
Kai kurias aviečių ligas sukelia virusas. Lapų garbanos pasireiškia kaip aviečių augalo šakų ir lapų susisukimas ir išbalimas, o visi užauginti vaisiai būna itin sėklingi ir sausi. Ši būklė dažnai atsiranda dėl užsikrėtimo laukinių aviečių lopais. Mozaikinė liga yra viena iš daugelio aviečių ligų, kurios paveikia ir vaisius, ir lapus bei mažina bendrą augalo dydį. Dėl venų chlorozės aviečių lapai pašviesėja ir iškraipomi, taip pat apskritai sutrumpėja augalas.
Norint išvengti arba kontroliuoti aviečių grybelinės kilmės ligas, ekspertai rekomenduoja tinkamai ravėti ir genėti augalus, kuriuose būtų daug oro. Augalams, kurie laistomi per drėkinimo sistemą, vengiant ilgo per didelės drėgmės laiko, galima sumažinti grybelių invaziją. Fungicidai gali padėti valdyti grybelines ligas, kai jos atsiranda. Tokios būklės kaip vidurių pūtimas yra veiksmingiau sprendžiamos naudojant insekticidą.