Biodyzelinas yra pagrindinis alternatyvios energijos šaltinis, pagamintas iš „žaliųjų“ ir tvarių žaliavų. Biodyzelino privalumai yra tai, kad jis mažina priklausomybę nuo iškastinio kuro, mažiau teršia ir yra atsinaujinantis. Vienas iš biodyzelino trūkumų yra susidarančių atliekų kiekis. Biodyzelino atliekas daugiausia sudaro glicerolis, dar žinomas kaip glicerinas, ir metanolis, su mažesniais kiekiais kitų priemaišų. Nors glicerolis yra nekenksmingas ir potencialiai naudingas, biodyzelino gamybos atliekos yra žemo grynumo ir dėl metanolio ir kitų medžiagų yra netinkamos naudoti ir tampa toksiškos.
Biodyzelino gamyba apima procesą, vadinamą peresterifikavimu, kurio metu augalinis aliejus reaguoja su metanoliu, naudojant natrio arba kalio hidroksidą kaip katalizatorių, kad būtų gautas riebalų esterių mišinys, kurį sudaro biodyzelinas. Kitas šios reakcijos produktas yra glicerolis. Paprastai kiekvienai dešimčiai biodyzelino dalių pagaminama viena dalis glicerolio. Praktiškai dauguma biodyzelino gamintojų naudoja iki dvigubai daugiau metanolio, nei iš esmės reikia reakcijai, kad būtų užtikrinta, jog visa alyva būtų paversta. Todėl likusiame glicerolyje yra didelė dalis metanolio ir nedidelis kiekis muilo, susidarančio dėl katalizatoriaus reakcijos su augaliniu aliejumi.
Metanolį galima išgauti distiliuojant ir pakartotinai panaudoti; tačiau likęs glicerolis vis tiek turės metanolio pėdsakų ir kitų priemaišų. Glicerolio valymas, kad jį būtų galima parduoti, yra brangus, o nuo 2011 m. tokiu būdu pagaminama tiek daug glicerolio, kad sunku rasti jam rinkos. Tai reiškia, kad biodyzelino gamintojams gali likti didelis kiekis žemos kokybės glicerolio, kurį reikia išmesti. Dėl nuodingų priemaišų jo negalima nuplauti, paskleisti ant žemės ar užkasti sąvartynuose, o gamintojams gali tekti sumokėti už jų išvežimą.
Biodyzelino atliekų naudojimas yra iššūkis, tačiau nuo 2011 m. buvo pateikta daug pasiūlymų. Viena iš idėjų yra naudoti įprastos E. coli bakterijos padermę, kad glicerolio atliekas fermentacijos būdu paverstų sukcinatais ir formiatais – įvairiais pritaikymais cheminėmis medžiagomis. Kitas pasiūlymas – biodyzelino atliekas derinti su žemės ūkio biomasės atliekomis, kad būtų sukurtas kietasis kuras – tai yra dviejų atliekų produktų pakartotinio panaudojimo pranašumas. Naudoti glicerolio atliekas kartu su kitais biomasės produktais kaip žaliavą poliuretano putoms gaminti buvo pasiūlytas nebrangus šio plačiai naudojamo produkto gamybos būdas. Eksperimentai patvirtino, kad tam tikros rūšies dumbliai, vadinami Schizochytrium limacinum, gali žalią glicerolį paversti dokozaheksano rūgštimi (DHR), omega-3 polinesočiųjų riebalų rūgščių rūšimi, kuri žinoma naudinga žmonių sveikatai. Tai yra dar viena galimybė tinkamai panaudoti biodyzelino atliekas.