Daugumai vabzdžių, paukščių ir žinduolių rūšių išgyventi reikalinga specifinė buveinė. Buveinė suteikia maistą ir lizdus ar veisimosi vietas. Kai buveinės sunaikinamos, daugelis rūšių išmiršta. Dvi pagrindinės buveinių naikinimo priežastys yra ta, kurią sukelia žmogaus veikla, pavyzdžiui, statyba ir ūkininkavimas, ir gamtos sukeltas naikinimas, pvz., gaisrai, žemės drebėjimai ir kitos stichinės nelaimės.
Buveinę sudaro specifiniai vietiniai augalai ir sąlygos, kurios yra paukščių, žinduolių ir vabzdžių namai ir veisimosi vieta. Daugelis buveinių yra būdingos vietovei ir klimatui ir yra labai pažeidžiamos. Pavyzdžiui, šlapžemėse yra ypač daug floros ir faunos, jos taip pat gali būti pažeidžiamos. Taip pat atogrąžų miškai yra daugybė buveinių daugybei rūšių. Kitos buveinės yra vidutinio klimato miškai, pievos ir prerijos.
Viena iš pagrindinių buveinių naikinimo priežasčių yra miškų naikinimas. Miškų naikinimas paveikia vidutinio klimato, subtropikų ir atogrąžų zonas. Miškų naikinimas įvyksta, kai iškertama dauguma arba visi medžiai rajone, siekiant išvalyti žemę statybai, žemės ūkiui arba pačiai medienai. Daugelis subtilių ekosistemų, ypač tropikuose, kasdien sunaikinamos dėl miškų naikinimo.
Šlapžemių užpildymas namams ir kitoms konstrukcijoms statyti taip pat yra pagrindinė buveinių naikinimo priežastis. Vienas tvenkinys gali sukurti unikalią aplinką, kuri palaiko daugybę skirtingų rūšių. Jei kūrėjas, miesto ar namo savininkas užpildys tvenkinį, buveinė bus sunaikinta, o rūšys, kurios ja rėmėsi, bus iškeltos.
Žemės ūkis taip pat sukelia buveinių naikinimą, kai miškai kertami plynai, kad būtų vietos ūkininkavimui ir gyvulių auginimui. Trąšų ir pesticidų naudojimas taip pat gali sunaikinti buveines, kai cheminės medžiagos patenka į vietinius vandens kelius ir pasklinda po ekosistemas, pakeisdamos dažnai trapią pusiausvyrą. Didelis ūkinių gyvūnų gaminamo mėšlo kiekis taip pat patenka į vandens kelius, dar labiau padidindamas taršą. Daugelio rūšių buveinė priklauso nuo ežerų, upelių ir upių, o kai šios teritorijos sutepamos, buveinė prarandama. Užtvankos taip pat sunaikina buveines, nes neleidžia migruojančioms žuvims persireguliuoti į savo nerštavietes.
Žmogaus veikla nėra vienintelė buveinių naikinimo priežastis. Pati gamta nuolat kinta ir keičiasi, o įvykus pokyčiams dažnai prarandamos ištisos buveinės. Pavyzdžiui, žaibo sukelti laukiniai gaisrai gali sunaikinti miškų ir pievų buveines.
Be to, potvyniai keičia subtilią gėlo vandens upelių, upių ir šlapžemių dinamiką, o viršvalandžių buveinės palaipsniui keičiasi. Pavyzdžiui, pelkė gali išdžiūti ir tapti pieva, sunaikindama buvusią buveinę, bet sukurdama naują. Lygiai taip pat pievos gali virsti pelkėmis.
Tačiau žmogaus įsikišimas daro didžiausią žalą ekosistemoms ir buveinėms. Netgi pasodinus sodą, pilną egzotiškų ir nevietinių augalų, sumažėja vietinių rūšių buveinių kiekis. Todėl daugelis sodininkų sodina vietinius augalus savo soduose, kad padėtų atkurti vystymosi metu prarastas buveines.