Melatoninas yra cheminė medžiaga, kuri natūraliai atsiranda smegenyse, tačiau ji taip pat gaminama kaip priedas, naudojamas kaip miego priemonė ir cirkadinio ritmo problemų gydymas. Šis priedas paprastai yra gerai toleruojamas tarp daugelio žmonių, tačiau yra neigiamos melatonino sąveikos su kai kuriais vaistais galimybė. Ši sąveika gali pakeisti šių vaistų poveikį organizmui, todėl kiekvienas asmuo, vartojantis melatoniną su kitu vaistu, turėtų žinoti apie šią galimą melatonino sąveiką.
Kraujospūdį mažinantys vaistai, tokie kaip klonidinas, gali būti mažiau veiksmingi pacientams, taip pat vartojantiems melatoniną. Kraujospūdžiui reguliuoti naudojami kalcio kanalų blokatoriai gali sumažinti į smegenis patenkančio melatonino kiekį. Beta adrenoblokatoriai, vartojami kraujospūdžiui mažinti, gali neveikti melatonino papildų, tačiau jie gali sumažinti organizmo gaminamą melatonino kiekį.
Melatoninas gali neigiamai paveikti steroidinius vaistus, kurie mažina imuninės sistemos atsaką. Dėl melatonino sąveikos su kortikosteroidais jie gali nustoti veikti. Taip pat gali būti paveikti kiti vaistai, naudojami uždegiminiam atsakui tarpininkauti, pvz., nesteroidiniai vaistai nuo uždegimo (NVNU), tokie kaip ibuprofenas. Šie vaistai gali sumažinti šio priedo veiksmingumą, mažindami jo koncentraciją plazmoje.
Buvo pranešta apie rimtą melatonino sąveiką su kai kuriais antidepresantais. Antidepresantai jau padidina natūralų melatonino kiekį, todėl pridėjus daugiau šio papildo gali atsirasti į perdozavimą panašių simptomų. Šie simptomai gali būti sumišimas, atminties praradimas, didelis mieguistumas ir kvėpavimo sutrikimas. Ne visi antidepresantai gali sukelti šiuos simptomus, tačiau pasikonsultavus su gydytoju prieš maišant juos su melatoninu, galima išvengti pavojingų komplikacijų.
Antikoaguliantų vartojimas kartu su šiuo priedu taip pat gali sukelti neigiamą melatonino sąveiką. Melatoninas slopina kraujo krešulių susidarymą, todėl sumaišius jį su antikoaguliantais, tokiais kaip varfarinas, gali labai slopinti krešėjimą po kūno pjūvio. Todėl šių dviejų derinys gali turėti pavojingų pasekmių.
Šio papildo maišymas su insulinu ir kitais vaistais nuo diabeto gali sukelti pavojingų pasekmių. Paprastai melatoninas vaidina svarbų vaidmenį didinant cukraus kiekį kraujyje. Todėl jis linkęs veikti prieš vaistus nuo diabeto, kurie mažina cukraus kiekį. Ypatingais atvejais melatoninas gali neleisti šiems vaistams veikti.
Tyrimai parodė galimą melatonino ir kai kurių tipų antipsichozinių vaistų sąveiką. Antipsichoziniai vaistai po tam tikro laiko gali sukelti būklę, vadinamą vėlyvąja diskinezija. Dėl šios būklės pasikartojantys veido ir burnos judesiai, ypač lūpų daužymas ir liežuvio judesiai. Viename tyrime dalyvavę asmenys po melatonino vartojimo sumažino polinkį į tokį elgesį, nors poveikis buvo tik laikinas.