Vyrų ir moterų kirkšnies skausmo priežastys gali labai skirtis; dėl to, kad kirkšnis yra arti lytinių organų, skausmą gali sukelti būklės, turinčios įtakos vyrų ir moterų lytiniams organams. Vyrų kirkšnies skausmas dažniausiai atsiranda dėl pagrindinių problemų, turinčių įtakos vyrų lytiniams organams, o moterų kirkšnių skausmas gali turėti įvairių priežasčių, nesusijusių su ginekologinėmis ligomis.
Klubo sąnarių sužalojimai dažniausiai yra viena dažniausių moterų kirkšnies skausmo priežasčių. Net jei problema atsiranda kitoje srityje, skausmas gali būti jaučiamas kirkšnyje. Tai žinoma kaip nurodytas skausmas. Klubo sąnario sužalojimas dažnai atsiranda dėl per didelio ploto naudojimo, pakartotinai atliekant tuos pačius judesius. Klubo sąnario pažeidimas taip pat gali būti dėl traumos šioje srityje.
Moterų kirkšnies skausmas gali atsirasti ir dėl išvaržos. Tai būklė, kai vienas iš kūno vidaus organų, paprastai žarnynas, prasiveržia pro aplinkinius audinius ir prasiskverbia pro pilvo gleivinę. Dėl šios būklės pilve dažnai susidaro gumbas, kurį galima jausti ir matyti. Kadangi išvarža dažniausiai atsiranda taip arti kirkšnies, ji gali sukelti stiprų skausmą šioje srityje.
Viena iš moterų kirkšnies skausmo priežasčių gali būti kiaušidžių cista. Kiaušidžių cistos yra maži maišeliai, kurie gali išsivystyti ant kiaušidžių. Mažos kiaušidžių cistos dažniausiai nesukelia jokių simptomų, tačiau didesnės cistos gali sukelti skausmą kirkšnyje. Sunkiais atvejais kiaušidžių cistos gali prisipildyti krauju ir sprogti, todėl gali atsirasti vidinis kraujavimas.
Bėrimai kirkšnies srityje taip pat gali prisidėti prie moterų kirkšnies skausmo. Mielių infekcija, būklė, kurią sukelia per didelis grybelio susikaupimas makštyje ir gali sukelti raudoną, niežtintį bėrimą ant kirkšnies srities paviršiaus. Kita dažna bėrimų kirkšnies srityje priežastis yra grybelis – odos infekcija, kuri atsiranda dėl sąlyčio su grybeliu ir sukelia stiprų niežulį bei paraudimą.