Dažniausiai naudojamos šeimos terapijos teorijos yra struktūrinės, strateginės, kartų, sisteminės ir patirtinės. Šeimos terapija naudojama spręsti šeimos narių problemas. Įvairių metodų poreikis kyla dėl įvairių problemų, asmenybių ir situacijų, kurios gali atsirasti, todėl dažnai reikia individualaus gydymo. Profesionalūs terapeutai dažniausiai nustato reikalingą terapijos metodą, įvertinę dalyvaujančius pacientus ir rinkdami informaciją apie bet kokias jiems iškilusias problemas.
Struktūrinės šeimos terapijos teorijos naudoja sąveiką ir šeimos struktūrų stebėjimą, kad nustatytų, kokias problemas reikia spręsti ir keisti. Terapeutas tiesiogiai dalyvauja ir gali veikti kaip šeimos narys, padedantis praktikuoti bendravimą. Šeimos sąveikos diagnozė reikalinga norint nustatyti problemines sritis ir rasti sprendimus, kurie leistų šeimos vienetui išvengti nesusipratimų ir žodinių kliūčių. Keletas pirminių metodų, naudojamų šioje šeimos terapijos technikoje, yra pertvarkymas, išbalansavimas, pertvarkymas ir įgyvendinimas.
Strateginė terapija dažnai naudojama individo problemoms spręsti per jo ar jos šeimos narius. Terapeutai, kurie taiko strategines šeimos terapijos teorijas, domisi šeimos kilme, bendravimo įgūdžiais ir santykių dinamika. Kai kurie metodai apima genogramos kūrimą, kuri leidžia pacientams ir terapeutui sukurti šeimos medį. Pagrindinė informacija apie artimiausius ir išplėstinius šeimos narius kartais gali būti naudinga ieškant problemos priežasties. Kaip ir strateginė terapija, kartų šeimos terapijos teorijos taip pat remiasi perdavimo procesu, kurio metu požiūris, nerimas ir elgesys perduodami iš kartos į kartą.
Sisteminė šeimos terapija yra labai pagrįsta tuo, kad šeima dirba kaip visuma ir į individualias problemas žiūri kaip į šeimos problemas. Dauguma terapeutų šeimos nariai bendrauja tarpusavyje, kad nustatytų santykių tipus ir kaip kiekvienas šeimos narys suvokia kitus. Kai terapeutas stebi, kaip šeima bendrauja, jis arba ji gali pasiūlyti vaidmenų žaidimą arba pakeisti požiūrį, kad parodytų šeimos nariams alternatyvius problemų sprendimo būdus. Vykdydamas šias veiklas, terapeutas gali išvengti bet kurio šeimos nario kaltės ir leidžia jiems patirti šeimos gyvenimą vienas kito akimis.
Patirties terapija akcentuoja nuoširdžių emocijų išlaisvinimą, dabarties aptarimą ir individualių vaidmenų atlikimą. Vienas iš pagrindinių tikslų – išvengti kaltinimų ir emocinio slopinimo, kuris gali sukelti papildomą įtampą namuose. Yra daugybė kitų šeimos terapijos teorijų, o pacientai gali atlikti daugiau nei vieną, kol suranda šeimai tinkamą terapiją. Buvo atlikti išsamūs daugelio šių teorijų tyrimai, o pacientai turėtų ištirti programas, kad nustatytų, kuri iš jų gali būti tinkamiausia jų konkrečioms šeimos problemoms spręsti.