Estrogenas yra hormonas, kuris dominuoja pirmoje moterų menstruacinio ciklo dalyje, o progesteronas linkęs dominuoti antroje dalyje, iškart po ovuliacijos. Abu hormonai turi būti subalansuoti, kad būtų galima pastoti, todėl per mažas ar per didelis estrogenų kiekis neigiamai veikia vaisingumą. Turint per mažai šio hormono, gimdos gleivinė gali būti per plona, kad būtų galima pastoti, ir netgi gali visiškai sustabdyti ovuliaciją. Per daug estrogenų gali sukelti lytinio potraukio sumažėjimą ir netgi sukelti reprodukcines problemas, tokias kaip PCOS ar endometriozė. Estrogeno poveikis vaisingumui taip pat gali būti stebimas vyrams, nes kai kuriuose yra per didelis šio hormono kiekis.
Pirmąją menstruacinio ciklo pusę kontroliuoja estrogenai, kurie leidžia kūnui ovuliuoti iki ciklo vidurio. Jei nėra pakankamai estrogeno, organizmas greičiausiai nevyks ovuliacijos arba neišleis kiaušinėlių. Moteris paprastai gali suprasti, kad ovuliacija nevyksta reguliariai, kai per visą ciklą nepastebi daug gimdos kaklelio gleivių, taip pat kas mėnesį nustoja ateina mėnesinės, todėl akivaizdu, kad nepakankamas estrogenų kiekis turi neigiamą poveikį vaisingumui. Be to, jai gali pasireikšti karščio bangos, naktinis prakaitavimas ir galvos skausmas. Žemą estrogenų kiekį paprastai lemia per didelis lieknumas, per didelis fizinis krūvis arba pagrindinė sveikatos būklė, neleidžianti išsiskirti kiaušinėliams.
Nors per mažas estrogeno kiekis turi akivaizdų poveikį vaisingumui, taip pat žinoma, kad per didelis estrogenų kiekis taip pat gali pakenkti vaisingumui. Maždaug įpusėjus ciklui, iškart po ovuliacijos, hormonas progesteronas turėtų perimti viršų, o ciklas baigsis nėštumu arba gimdos gleivinės suirimu menstruacijų metu. Per daug estrogenų gali sukelti per mažai progesterono, taip pat gali sukelti medicininių problemų, kurios nėra palankios reguliariam ovuliacijai, pvz., endometriozę, PCOS, gimdos fibrozes ir gimdos vėžį. Be to, dominuojant estrogenams gali labai sumažėti lytinis potraukis, dėl to paprastai sumažėja lytinių santykių ir tikimybė pastoti. Estrogeno perteklių paprastai sukelia antsvoris, prasta mityba ir per didelis stresas.
Vyrų organizme yra nedidelis estrogeno kiekis, kurį dažnai subalansuoja daug testosterono. Kai kurie vyrai gamina per daug šio hormono arba vartoja jį dirbtinai, kad išspręstų tam tikras medicinines problemas. Deja, estrogenai turi neigiamą poveikį vyrų vaisingumui, pavyzdžiui, sumažėjęs lytinis potraukis ir mažas spermatozoidų skaičius. Todėl svarbu išspręsti šią problemą, kad pastojimas būtų tikėtinas.