Daugelis dietos besilaikančių žmonių pranešė apie ryšį tarp Atkinso dietos ir vidurių užkietėjimo, ypač pradinėje dietos fazėje. Ši fazė trunka apie dvi savaites ir jai būdingas labai mažas angliavandenių suvartojimas. Bet koks mitybos įpročių pasikeitimas gali sukelti problemų, tokių kaip vidurių užkietėjimas, tačiau kadangi organizmas pripranta prie pokyčių ir po įvadinės fazės leidžiama valgyti daugiau maisto produktų, vidurių užkietėjimo problema nėra tokia paplitusi. Yra strategijų, kurių reikia laikytis laikantis Atkinso dietos, o vidurių užkietėjimas turėtų išnykti po kelių dienų ar savaičių.
Vidurių užkietėjimas yra dažnas daugelio mažai angliavandenių turinčių dietų šalutinis poveikis. Viena iš Atkinso dietos kritikų yra ta, kad pradinėje fazėje dietos besilaikantys suvartoja mažiau nei 7% minimalaus paros skaidulų kiekio. Dėmesys dideliam baltymų kiekiui taip pat gali sustiprinti ryšį tarp Atkinso dietos ir vidurių užkietėjimo, nes gausus mėsos ir sūrio vartojimas gali sukelti žarnyno sutrikimus.
Organizmas turi turėti skaidulų, kad galėtų atsikratyti atliekų. Vaisiai, daržovės ir nesmulkintų kviečių produktai, tokie kaip duona ir dribsniai, yra įprasti sveikos mitybos ląstelienos šaltiniai. Rekomenduojamą 21 gramą skaidulų per dieną gali būti gana sunku suvartoti laikantis mažai angliavandenių turinčios dietos, pavyzdžiui, Atkinso dietos, todėl gana dažnai užkietėja viduriai. Kai kuriais atvejais problema gali tapti pakankamai sunki, kad prireiktų medicininės pagalbos.
Norint išvengti vidurių užkietėjimo dietos metu, būtina išgerti aštuonias stiklines vandens, nes vandens trūkumas yra pagrindinė vidurių užkietėjimo priežastis. Jei tai neturi jokio poveikio, gali padėti papildomo pluošto, pvz., linų sėmenų ar kviečių sėlenų, vartojimas. Salotos ir daržovės, ypač žalios, lapinės daržovės, tokios kaip špinatai, kopūstai ir brokoliai, yra visiškai priimtinos dietoje neribotais kiekiais, todėl užtikrinus, kad jie bus daugumos patiekalų dalis, padidės skaidulų suvartojimas. Didėjantis fizinis krūvis taip pat turėtų padėti gydyti vidurių užkietėjimą laikantis Atkinso dietos. Skaidulų papildas rekomenduojamas ypač Atkinso dietos 1 fazės arba įvadinės fazės metu, siekiant kompensuoti valgant daugiau mažai skaidulų turinčių baltymų.
Kiti šalutiniai Atkinso dietos poveikiai yra nuovargis, galvos svaigimas, galvos skausmas ir silpnumas, daugiausia dėl drastiško angliavandenių kiekio sumažėjimo ankstyvuoju dietos etapu. Atkinso dieta laikui bėgant pasikeitė ir šiek tiek sušvelnino savo požiūrį, kad būtų pašalintas susirūpinimas ir pranešimai apie šalutinį poveikį. Prieš pradedant laikytis šios ar kitos dietos, rekomenduojama pasitarti su gydytoju, ypač jei yra sveikatos problemų.