Yra daug dalykų, kurie gali sukelti vėžį, ir nors burnos skalavimo skystį kasdien naudoja daugelis žmonių, kai kurios tyrimų grupės ir eksperimentai nustatė ryšį tarp burnos skalavimo skysčio ir vėžio. Ryšys tarp vėžio ir burnos skalavimo skysčio pirmiausia yra didelės alkoholio koncentracijos daugumoje burnos skalavimo skysčių rezultatas, tačiau kai kurie mokslininkai teigia, kad net nealkoholinis burnos skalavimo skystis gali būti vėžinis. Viena iš priežasčių yra ta, kad alkoholis suyra ir sudaro vėžį sukeliančią medžiagą, vadinamą acetaldehidu. Burnos skalavimo skystis dažnai paveikia dantenas ir dantis, ypač naudojant alkoholio turinčius variantus, todėl į žmones lengviau patenka kitos vėžį sukeliančios medžiagos. Tai pirmiausia sukelia burnos vėžį, tačiau gali atsirasti ir kitų kaklo ir galvos vėžio atvejų.
Yra žinoma, kad alkoholis didelėmis dozėmis sukelia vėžį, o burnos skalavimo skystyje paprastai būna labai didelė alkoholio koncentracija. Jis naudojamas naikinti mikrobus ir dezinfekuoti burną, tačiau taip pat žmonės gauna pakankamai alkoholio, kad būtų laikomas pavojingu, ypač dėl reguliaraus burnos skalavimo skysčio naudojimo. Tuo pačiu metu kai kurie mokslininkai teigia, kad nealkoholinis burnos skalavimo skystis ir vėžys yra susiję, daugiausia dėl valymo priemonių nealkoholiniame burnos skalavimo skystyje.
Kai alkoholis skyla, jis išskiria medžiagą, vadinamą acetaldehidu, kuri, kaip žinoma, sukelia vėžį. Žmogui naudojant burnos skalavimo skystį, nedideli burnos skalavimo skysčio telkiniai paprastai lieka burnoje, net jei jis ar ji skalauja. Dėl to alkoholis suyra tiesiai burnoje, aplink dantenas ir dantis, o tai gali padidinti burnos skalavimo skysčio ir vėžio riziką.
Pagrindinė priežastis, kodėl manoma, kad burnos skalavimo skystis ir vėžys yra susiję, yra ta, kad burnos skalavimo skystis gali sukelti dantų ir dantenų eroziją dėl rūgšties ir alkoholio. Kai atsiranda ši erozija, alkoholis ar valymo priemonės lengviau patenka į kūną. Jei asmuo vartoja kitas vėžį sukeliančias medžiagas, tokias kaip cigaretės ar alkoholiniai gėrimai, jie taip pat gali patekti giliau į kūną. Dėl to medžiagos netgi gali įstrigti po dantenomis, o tai gali dar labiau padidinti riziką.
Daugelis vėžio formų gali pasireikšti nuo burnos skalavimo skysčio, tačiau yra trys tipiškos versijos. Burnos vėžys yra labiausiai paplitęs, nes didžioji dalis skalavimo skysčio poveikio yra tiesiogiai burnoje. Burnos skalavimo skystis gali būti netyčia prarytas ir, kadangi alkoholis ir valymo priemonės per burną gali prasiskverbti į kitas kūno dalis, naudojant burnos skalavimo skystį taip pat gali atsirasti kaklo ir galvos vėžys.