Ryšys tarp estrogenų ir spuogų yra šiek tiek sudėtingas, nes hormonų svyravimai įprasto moters menstruacinio ciklo metu gali sukelti spuogus skirtingu metu. Mažas estrogenų kiekis ir proporcingai didesnis androgenų hormonų kiekis paprastai sukelia su estrogenais susijusius cistinius spuogus. Hormonų disbalansas, mažinantis estrogenų kiekį arba padidinantis androgenų kiekį, padidins spuogų susidarymo tikimybę, nes padidina riebalinių liaukų, esančių po odos paviršiumi, gaminamo aliejaus kiekį. Kontraceptinės tabletės gali palengvinti kai kuriuos sunkius spuogus, nes jos kruopščiai palaiko estrogenų ir androgenų kiekį kraujyje.
Androgenai yra pagrindinė daugelio moterų spuogų priežastis, susijusi su hormonais. Šie hormonai skatina riebalines liaukas gaminti riebią medžiagą, vadinamą riebalais. Per daug šios medžiagos dažnai gali įstrigti porose ir sudaryti dirvą įprastoms odos bakterijoms, kurios dauginasi po odos paviršiumi. Kai bakterijos padaugėja, jos dažnai gali sukelti uždegimą, dėl kurio atsiranda cistiniai spuogai. Estrogenai gali panaikinti arba užmaskuoti androgenų poveikį organizmui.
Didelis estrogeno kiekis ir spuogai atsiranda priešingu metu įprasto menstruacinio ciklo metu. Pirmoje ciklo pusėje, prieš įvykstant ovuliacijai, estrogenų kiekis palaipsniui didėja. Tai ne tik sumažina androgenų poveikį organizmui, bet ir sumažina spuogų atsiradimą. Kūnas pasiekia savo estrogeno piką prieš pat ovuliaciją, o po to estrogeno lygis palaipsniui mažėja. Spuogai paprastai padaugėja po ovuliacijos, vadinamą lutealine faze, ir jie tampa blogiausi prieš pat menstruacijas.
Liutealinėje ciklo fazėje pamažu pakyla progesterono – hormono, kuris turi ir estrogenų, ir androgenų savybių. Progesterono svyravimai gali padidinti pilvo pūtimą ir skysčių kiekį, o tai savo ruožtu išspaudžia veido poras. Šis porų dydžio sumažėjimas dažnai pablogina spuogų simptomus, nes dar labiau riboja organizmo gebėjimą pašalinti riebalų perteklių.
Kontraceptinės tabletės užtikrina kruopščiai kontroliuojamą estrogeno ir progesterono kiekį kraujyje. Išlaikant vienodą estrogenų kiekį visą mėnesį, tabletės gali sumažinti androgenų poveikį liuteininės fazės metu, be to, sumažina bendrus hormonų svyravimus. Dėl to daugeliui moterų sumažėja spuogų, ypač tų, kurios prieš pradedant gydymą patyrė sunkų hormonų disbalansą.