Sąvoka „flora“ dažnai vartojama apibrėžiant visus augalus, grybus ir dumblius tam tikroje aplinkoje, o fauna reiškia ten gyvenančius gyvūnus. Mokslinis floros ir faunos apibrėžimas yra augalai ir gyvūnai, gyvenantys tam tikroje vietovėje ar tam tikru metu. Skirtumas tarp jų kyla dėl to, ar kalbama apie augalus ar gyvūnus.
Botanikoje arba augalų tyrime flora iš tikrųjų turi du skirtingus apibrėžimus. Pirma, tai gali reikšti tam tikros aplinkos ar laikotarpio augalus, kaip nurodyta aukščiau, arba gali reikšti knygą ar tokį kūrinį, kuriame aprašomi augalai siekiant identifikuoti. Šis pirmasis apibrėžimas yra labiausiai paplitęs ir konkrečiai susijęs su tomis augalų rūšimis, kurios yra vietinės vietovės ar laiko. Vietinė rūšis, nesvarbu, ar tai būtų augalas, ar gyvūnas, yra ta, kuri atsirado tam tikroje vietovėje ir toliau auga bei išgyvena be žmogaus įsikišimo. Priešingos vietinėms rūšims yra introdukuotos.
Tiek flora, tiek fauna turi daugiau klasifikacijų arba poskyrių. Flora klasifikacija priklauso nuo regiono, klimato, aplinkos ir aprašomų augalų laikotarpio. Faunos suskirstymas daugiausia grindžiamas gyvūnų gyvenimo vieta ir dydžiu.
Visoje planetoje yra daug skirtingų floros regionų. Kai kurie regionai gali būti tokie dideli kaip ištisi žemynai arba tokie maži kaip pelkės ar kalnuoti regionai. Be geografinių vietovių, klimatas ir laikotarpiai gali suskirstyti skirtingus augalus į floras. Augalai taip pat gali būti grupuojami į vietinę, žemės ūkio ir sodo bei piktžolių florą.
Naudojami septyni skirtingi faunos poskyriai, atsižvelgiant į gyvūnų buvimo vietą ir jų dydį. Infauna ir epifauna yra vandens gyvūnai, kurie gyvena atitinkamai vandenyno dugne arba jo apačioje. Mikrofauna yra mikroskopinio dydžio, o meiofauna yra šiek tiek didesnė ir gyvena tiek parduodamoje, tiek gėlo vandens dirvožemio aplinkoje. Makrofauna yra mažyčiai dirvožemio organizmai, didesni už meiofauną, bet mažesni už sliekus ir nematodus, kurie priklauso mezofaunų grupei. Megafauna yra dideli gyvūnai konkrečioje aptariamoje aplinkoje.
Regiono florą ir fauną atskirai ir kartu tiria daugybė skirtingų mokslininkų. Botanikai arba augalų mokslininkai daugiausia tiria florą, o zoologai – fauną. Ekologai ir gamtosaugą tyrinėjantys asmenys žiūri į abu kartu, nes šios dvi grupės yra priklausomos viena nuo kitos, kad išgyventų.