Geriausias būdas sunaikinti parazitus yra naudoti antiparazitinį vaistą, kuris buvo sukurtas taip, kad būtų nukreiptas į specifinius parazitus, susijusius su infekcija. Daugelis vaistinių turi platų tokių vaistų asortimentą, o retoms infekcijoms gydyti žmonės gali užsisakyti specializuotų vaistų iš vaistinių, kurių specializacija yra tokie produktai, arba tiesiogiai iš vyriausybinių agentūrų, išduodančių retus vaistus. Žmonės, turintys ribotų lėšų tokiems vaistams įsigyti, gali gauti jų nemokamai arba už mažesnę kainą per vyriausybines programas ir privačias pagalbos organizacijas.
Kai kas nors įtaria, kad jis ar ji užsikrėtė parazitine infekcija, svarbu kreiptis į gydytoją, kad jis patvirtintų infekciją ir nustatytų, kokio tipo parazitas yra susijęs. Net jei žmonės mato parazitus, pavyzdžiui, žarnyno parazitų atveju, kai jie patenka su išmatomis, daugelis parazitų gali atrodyti panašiai, o žmonės, neturintys patirties, gali klaidingai atpažinti parazitus, o tai gali apsunkinti gydymą. Gydytojas, įvertinęs pacientą, gali nustatyti, kuris organizmas sukelia infekciją, ir paskirti tinkamus vaistus.
Nors yra generinių antiparazitinių vaistų, šie vaistai ne visada gali sunaikinti parazitus, ypač jei kas nors serga reta infekcija. Veiksmingiausi vaistai parduodami tik su receptu, kad būtų užtikrintas tinkamas jų vartojimas. Baigęs vaistų, skirtų parazitams naikinti, kursą, pacientas gali grįžti pas gydytoją, kad patikrintų, ar parazitai buvo pašalinti, ypač jei pacientas sirgo infekcija, pvz., maliarija, susijusia su vaistams atspariais organizmais, kurie gali reikia antrojo gydymo kurso.
Yra daugybė liaudiškų gydymo būdų, kurie tariamai naikina parazitus, pavyzdžiui, rekomendacijos valgyti tam tikrą maistą, vartoti augalinius preparatus ar egzotiškesnius dalykus, pavyzdžiui, puodelius aliejaus ar kramtomąjį tabaką. Šie parazitų gydymo būdai nerekomenduojami, nes jie gali būti bent jau neveiksmingi, todėl infekcija išliks ir gali išsivystyti komplikacijų, o blogiausiu atveju jie gali būti labai pavojingi.
Pacientams, kurie griežtai prieštarauja įprastinių antiparazitinių vaistų vartojimui parazitams naikinti, reikia pasitarti su gydytoju, kad nustatytų, kokios natūralios priemonės būtų tinkamiausios. Gydytojas natūropatas, tradicinės kinų medicinos specialistas arba alternatyvioms medicinos galimybėms draugiškas gydytojas gali nustatyti susijusius parazitus ir rekomenduoti gydymo kursą. Vėlgi, svarbu vengti gydymo namuose be konsultacijos, nes neteisingai identifikavus gali būti naudojamas netinkamas gydymas.