Gliukozamino sulfato šalutinis poveikis paprastai yra lengvas, nors apie visus varginančius simptomus, atsirandančius po šio vaisto vartojimo, reikia pranešti gydytojui, kad jis atliktų tolesnį medicininį įvertinimą. Kai kurie dažniausiai pastebėti šalutiniai poveikiai yra pykinimas, viduriavimas ar vidurių užkietėjimas. Papildomas gliukozamino sulfato šalutinis poveikis gali būti galvos skausmas, galvos svaigimas ar odos reakcijos. Tie, kurie yra alergiški vėžiagyviams arba serga cukriniu diabetu, šį vaistą turėtų vartoti tik tiesiogiai prižiūrint gydytojui. Visus klausimus ar rūpesčius dėl galimo gliukozamino sulfato šalutinio poveikio individualiai reikia aptarti su gydytoju ar kitu medicinos specialistu.
Virškinimo trakto sutrikimai yra vienas iš dažniausiai pasitaikančių gliukozamino sulfato šalutinių poveikių. Tokie simptomai gali būti pykinimas, vėmimas ar viduriavimas. Kai kuriems pacientams gali pasireikšti vidurių užkietėjimas arba pakaitomis vidurių užkietėjimas ir viduriavimas. Taip pat gali pasireikšti rėmuo, apetito praradimas ar pilvo skausmas. Kai kuriuos iš šių šalutinių poveikių galima sumažinti vartojant vaistą su maistu ar pienu.
Vartojant gliukozamino sulfatą gali atsirasti nemiga, galvos skausmas ar galvos svaigimas. Šis vaistas gali padidinti kraujavimo riziką, ypač tiems, kuriems yra kraujavimo sutrikimų. Kai kurie vaistai ar vaistažolių papildai gali padidinti šią riziką, todėl prieš vartojant reikia pasitarti su gydytoju. Kai kuriems gliukozamino sulfatą vartojantiems žmonėms gali pasireikšti odos reakcijos, tokios kaip bėrimas, niežulys ar deginimo pojūtis. Nors šios odos reakcijos paprastai būna lengvos, apie bet kokius reikšmingus odos pokyčius reikia pranešti gydytojui, kad būtų išvengta galimos alerginės reakcijos.
Tie, kurie yra alergiški vėžiagyviams, turėtų vartoti šį vaistą tik tiesiogiai prižiūrint gydytojui. Gliukozamino sulfatas gaminamas iš krabų, omarų ar krevečių kiautų. Dauguma žmonių, kurie yra alergiški vėžiagyviams, reaguoja tik į šių būtybių mėsą, nors buvo keletas pranešimų apie panašias reakcijas vartojant šį vaistą.
Kai kurie gliukozamino sulfato šalutiniai poveikiai gali apimti cukraus kiekio kraujyje pokyčius arba astmos simptomus, tokius kaip kosulys, švokštimas ar pasunkėjęs kvėpavimas. Pacientai, sergantys cukriniu diabetu, prieš vartodami šį vaistą turėtų pasitarti su gydytoju, nes gali būti rekomenduojama dažniau tirti kraują. Sergantiems astma ar kitomis kvėpavimo takų ligomis gali būti nerekomenduojama vartoti gliukozamino sulfato.
Retais atvejais vartojant gliukozamino sulfatą gali pasireikšti sunki ir potencialiai pavojinga gyvybei alerginė reakcija, vadinama anafilaksija. Alerginės reakcijos simptomai gali būti veido patinimas, pasunkėjęs kvėpavimas ir krūtinės skausmas. Šiuos simptomus reikia gydyti kaip neatidėliotiną medicinos pagalbą, nes mirtis gali ištikti per kelias minutes be neatidėliotinos medicininės pagalbos.