Progesteronas, steroidinis hormonas C-21, gaminamas kiaušidėse, veikia kaip katalizatorius, skatinantis moters menstruacijų arba menstruacinio ciklo pradžią. Progesterono poveikis menstruacijoms atsiranda dėl to, kad jį slopina kitas hormonas – gonadotropiną atpalaiduojantis hormonas (GnRH). Vidutinis menstruacinis ciklas trunka 28 dienas, o maždaug antrą-trečią ciklo savaitę, vadinamą liuteine faze, progesterono kiekis moters sistemoje greitai pakyla. Didelis progesterono kiekis padengia endometriumą gimdoje į svetingą gleivinę embrionui implantuoti ir vystytis. Jei implantacija neįvyksta, GnRH slopina progesteroną neigiamo grįžtamojo ryšio kilpa, o progesterono gamybos sumažėjimas sukelia endometriumo išsiskyrimą.
Progesterono poveikis menstruacijoms sukelia normalų menstruacinį kraujavimą arba progesterono nutraukimo kraujavimą. Progesterono kiekio sumažėjimas moters ciklo pradžioje skatina endometriumo išsiskyrimą, nes didelis progesterono kiekis mažina gimdos raumenų susitraukiamumą. Kai lygis krinta, jei apvaisinimas neįvyko, gimda pradeda mėšlungį, nes progesteronas neslopina jos susitraukimo. Tai yra dalis to paties mechanizmo, kuris sukelia susitraukimus, kai moteris yra pasirengusi pagimdyti kūdikį. Nėštumo pabaigoje progesterono kiekis sumažėja, o vėliau prasideda gimdymas.
Progesterono gamybą kiaušidėse inicijuoja trečiasis su menstruacijomis susijęs hormonas, vadinamas liuteinizuojančiu hormonu (LH). Progesterono poveikis menstruacijoms prasideda, kai hipofizė pradeda gaminti LH, o tai sukelia progesterono antplūdį liuteininės fazės metu. Šios fazės metu aktyvuotas LH sukelia kiaušinėlio išsiskyrimą iš folikulo, vadinamą ovuliacija. Toliau vadovaujant LH, folikulas be kiaušinių formuojasi į geltonkūnį, o būtent geltonkūnis yra specifinis progesterono generatorius kiaušidėse. Ši struktūra toliau gamina progesteroną, kol jo lygis yra pakankamai aukštas, kad slopintų GnRH, o tai pagal neigiamą grįžtamojo ryšio kilpą sukelia progesterono koncentracijos mažėjimą, sukeldama menstruacijas.
Dėl ištirto progesterono poveikio menstruacijoms kontraceptinės tabletės (BCP) yra patikima kontracepcijos forma. Daugumoje BCP yra progesterono arba į progesteroną panašių medžiagų, kurios reguliuoja moters ciklą ir užtikrina, kad GnRH būtų slopinamas tinkamu laiku, kad būtų išvengta LH padidėjimo viduryje, kuris užkerta kelią ovuliacijai. Apvaisinimas ir nėštumas šioje situacijoje yra neįmanomi, nes iš folikulo neišsiskiria kiaušinėlis, kuris galėtų išsivystyti į embrioną.