Rudosios garstyčios šimtmečius buvo naudojamos kaip vaistas nuo paprastų dantų skausmų iki sunkių mažų vaikų traukulių gydyti. Nuorodos į garstyčias kaip vaistą paprastai reiškia rudąsias garstyčias. Toks vaistas paprastai išgaunamas iš jo lapų ir sėklų. Senovėje graikai taip vertino gydomąsias garstyčių savybes, kad laikė jas dovana žmonijai, kurią sukūrė gydymo dievas Asciepiusas.
Dažniausiai garstyčios kaip vaistas yra naudojamos kaip linimentas, kompresas ar tinkas. Garstyčių aliejus, švelniai dirgindamas odą, skatina kraujotaką, o tai malšina raumenų skausmą. Garstyčių kompresai buvo priskiriami tam, kad palengvintų tam tikrus bronchito ir pleurito atvejus.
Nurijus į vidų nedideliais kiekiais, garstyčių sudedamosios dalys gali būti naudojamos kaip vidurius laisvinančios arba virškinimui gerinti. Be to, vartojant nedideles dozes, ekstraktai gali šiek tiek uždegti skrandį ir sukelti prakaitavimą. Prakaitavimas kartais padeda gydyti karščiavimą, peršalimą ir gripą. Sėklos, nurytos dideliais kiekiais, gali sukelti vėmimą. Išgėrus arbatinį šaukštelį sėklų stiklinėje vandens, paprastai atsiranda vėmimas per 10 minučių. Todėl šis gydymas kartais naudojamas skubiam alkoholio ar narkotikų perdozavimo gydymui.
Indijoje garstyčios verdamos arbatoje raumenų ir kaulų skausmui malšinti, karščiavimui ir peršalimui gydyti. Kinai gydomosiomis garstyčiomis toliau gydo opas, abscesus ir skausmą, atsirandantį dėl reumato ir lumbago. Jie mano, kad lapai yra ypač naudingi gydant šlapimo pūslės uždegimą.
Papildomas garstyčių panaudojimas medicinoje apima gyvatės įkandimų ir skorpionų įgėlimų nuodų ataką, skausmo malšinimą dėl sumušimų ar sustingusio kaklo ir dieglių bei kvėpavimo problemų malšinimą. Teigiama, kad aliejus iš garstyčių sėklų lukštų skatina plaukų augimą. Jis taip pat buvo minimas kaip agentas, padedantis išgydyti grybelius.
Rudosios garstyčios taip pat kartais naudojamos kaip maisto papildas, padidinantis geležies, cinko, chromo ir seleno kiekį organizme. Jo aliejus dažnai naudojamas atliekant masažo terapiją. Ne visi rudųjų garstyčių naudojimo būdai yra naudingi. Rudosiose garstyčiose yra stipriai kvepiančios ir dirginančios cheminės medžiagos alilizotiocianato. Šis junginys karo metu buvo naudojamas garstyčių dujoms gaminti kaip cheminis ginklas.
Rudųjų garstyčių sėklose ir lapuose yra keletas sudėtingų cheminių medžiagų. Jie apima fermentus, gliukozinatus, sierą, baltymus ir gleives. Dėl šių cheminių medžiagų poveikio kai kurie chirurgai anksčiau, prieš operuodami pacientus, rankas dezinfekuodavo rudųjų garstyčių pasta.