Ryšys tarp evoliucijos ir religijos dažnai yra ginčytinas, kai kai kurie religiniai veikėjai meta iššūkį evoliucijos teorijai kaip įžeidimą savo įsitikinimams. Kai kuriems žmonėms tiek evoliucijos teorija, tiek religiniai įsitikinimai gali lengvai sugyventi ir tiesiog išplėsti vienas kitą, kad sukurtų platesnį vaizdą. Tačiau kitiems evoliucijos ir natūralios atrankos idėjos yra pernelyg diametraliai priešingos jų religinėms pažiūroms ir šios dvi idėjos tampa viena kitos nesuderinamos. Tačiau daugelis mokslininkų teigia, kad evoliucija ir religija nebūtinai turi būti išskirtinės idėjos ir kad evoliucija jokiu būdu nerodo jokios dievybės.
Didžioji dalis evoliucijos ir religijos konflikto kyla dėl to, kad evoliucijos teorija meta iššūkį kai kurių religijų kūrimo istorijoms. Pavyzdžiui, judėjų ir krikščionių tikėjimo sistemose kūrimo istorija kilusi iš Pradžios knygos, randamos ir krikščioniškoje, ir hebrajų Biblijoje. Šioje istorijoje sakoma, kad visatą ir viską, kas joje, sukūrė judėjų-krikščionių Dievas kartu su žmonija ir įvairiais augalais bei gyvūnais tam tikru būdu. Pažodinis šios istorijos skaitymas sukuria konfliktą tarp evoliucijos ir religijos.
Evoliucijos teorija iš esmės yra idėja, kad visa gyvybė Žemėje kyla iš bendro paveldimo šaltinio milijardus metų praeityje. Iš šio šaltinio per tūkstantmečius išsivystė ir išsivystė daugybė skirtingų gyvybės formų – nuo žuvų ir paukščių iki žinduolių ir roplių. Tačiau pažodinis Pradžios knygos sukūrimo istorijos skaitymas rodo, kad visata ir Žemė buvo sukurti tik per septynias dienas ir kad visos šiuolaikinės gyvybės formos buvo sukurtos kartu maždaug tuo pačiu metu. Šis skaitymas prieštarauja evoliucijai, todėl dažnai tai gali sukelti evoliucijos ir religijos susidūrimą.
Tačiau yra daug mokslininkų, kurie prieštarauja šiam konfliktui ir pabrėžia mintį, kad tiek evoliucija, tiek religija gali egzistuoti viename pasaulio požiūryje. Tik pažodinis tokių kūrimo istorijų aiškinimas atmeta galimybę matyti platesnį vaizdą. Daugeliui žmonių lengva suvokti šias sukūrimo istorijas kaip metaforinius vaizdus, kaip visata buvo sukurta, ir manyti, kad evoliucijos procesą stebėjo arba iš pradžių pradėjo geranoriška dievybė. Taip pat yra kai kurių religijų ir tikėjimo sistemų, kuriose šis konfliktas tarp evoliucijos ir religijos nėra problema ir kurios atvirai apima evoliucijos teoriją, neprieštaraudamos įvairiems religiniams įsitikinimams.