Atsiradus globalizacijai, prekyba tarp įvairių šalių tapo lengvesnė. Šios prekybos apimtys išaugo tiek, kad tiek nacionaliniu, tiek tarptautiniu lygmeniu buvo priimtos taisyklės prekybai stebėti. Šio stebėjimo proceso dalis yra muitinės tarnybos prie skirtingų valstybių sienų ar sienų steigimas, siekiant užtikrinti, kad importuotojai ir eksportuotojai laikytųsi šių taisyklių. Iš esmės pagrindinis muitinės ir tarptautinės prekybos ryšys yra tame, kad muitinė veikia kaip įvairių prekybos taisyklių ir įstatymų tikrintoja arba vykdytoja.
Viena iš muitinės ir tarptautinės prekybos sąsajų yra ta, kad muitinė veikia kaip kliūtis kai kuriems nesąžiningiems užsienio šalių pirkliams, kurie bando nepageidaujamas ar net toksiškas medžiagas išmesti į kitos šalies teritorines sienas. Kai kurie iš šių agentų gali bandyti nuodingas medžiagas į šalį patekti įvairiais būdais. Nedalyvaujant muitinės pareigūnams, jiems tai gali pasisekti. Kai kurie importuotojai ar eksportuotojai gali bandyti eksportuoti pavojingai nekokybiškus gaminius į kitas šalis. Dažniausiai muitinės agentai konfiskuoja tokius daiktus ir patraukia prekybininkus bei jų agentus baudžiamojon atsakomybėn. Jie taip pat gali patys sunaikinti toksines medžiagas.
Muitinę ir tarptautinę prekybą sieja tai, kad muitinė užtikrina, kad tiek importuotojai, tiek eksportuotojai laikytųsi įvairių susijusių nacionalinių ir tarptautinių įstatymų. Pavyzdžiui, viena šalis, uždraudusi vištienos produktų importą iš kitos dėl paukščių gripo protrūkio, nurodys muitinei užtikrinti, kad šis draudimas būtų įgyvendintas. Šiuo tikslu visi aptikti susiję produktai bus konfiskuojami ir sunaikinami. Kai kurios šalys gali nustatyti prekybos kvotas, ribojančias prekių, kurios gali būti importuojamos arba eksportuojamos per tam tikrą laikotarpį, skaičių arba apimtį. Pasiekus šios kvotos limitą, muitinė pasirūpins, kad jokiam importuotojui ar eksportuotojui nebūtų leista importuoti ar eksportuoti prekės.
Kitas ryšys tarp muitinės ir tarptautinės prekybos yra tai, kad muitinė užkerta kelią bet kokiai tarptautinei prekybai nelegaliais daiktais. Pavyzdys yra tas, kad baltasis raganosis buvo paskelbtas nykstančia rūšimi, kurios laukinėje gamtoje liko tik sauja. Tačiau kai kurios šalys vis dar prekiauja gyvūnu, ypač jo ragu, kuris naudojamas įvairiems mišiniams, pavyzdžiui, afrodiziakams, gaminti. Muitinė užkerta kelią prekybai tokiais nykstančių gyvūnų, augalų ir kitais draudžiamais daiktais.