Smegenų kamienas ir smegenėlės turi individualų vaidmenį kognityvinėse funkcijose ir motorikos valdyme. Panašiai kaip ir kitos smegenų dalys ir visas kūnas, smegenų kamienas ir smegenėlės turi skirtingus tikslus. Kai jų tikslai sujungiami, tampa akivaizdu, kiek smegenų kamienas ir smegenėlės priklauso vienas nuo kito ir atvirkščiai, bendrame smegenų funkcionavime. Veikla gali prasidėti vienoje srityje arba gali vykti vienu metu.
Smegenų kamienas yra galvos ir smegenų gale esanti dalis, esanti nugaros smegenų viršuje. Pagrindinė jo pareiga – užtikrinti sensorinį ir motorinį kaklo ir veido valdymą. Smegenų kamiene yra visos nervų jungtys, kurios eina iš smegenų į likusį kūną. Jis kontroliuoja centrinę nervų sistemą, širdies funkcijas ir kvėpavimą. Be to, smegenų kamienas taip pat atlieka lemiamą vaidmenį palaikant miego ir pabudimo ciklą.
Priešingai, smegenėlės yra apatinėje smegenų srityje, ištemptos po abiem pusrutuliais, o smegenų kamieno dalis yra priekyje. Smegenėlės taip pat reguliuoja motorinę kontrolę, kuri vienu būdu sujungia smegenų kamieną ir smegenis. Kognityvines funkcijas, tokias kaip kalba, reguliuoja smegenėlės. Tai taip pat vaidina svarbų vaidmenį kai kuriuose emocijų atsakymuose. Nors smegenų kamienas pirmiausia kontroliuoja judėjimo pradžią. Smegenėlės padeda judesiams reguliuoti laiką ir koordinaciją.
Smegenų kamienas ir smegenėlės gali būti atsakingi už skirtingų funkcijų reguliavimą, tačiau jie taip pat veikia kartu. Jei smegenėlės bus pažeistos, mažai tikėtina, kad paralyžius būtų rezultatas, nes pagrindinį variklio valdymą tvarko smegenų kamienas. Tačiau smegenų kamieno pažeidimas gali sukelti paralyžių, bet taip pat gali sukelti kitų funkcijų trūkumą. Kai kuriais atvejais smegenėlės gali kompensuoti nedidelius sužalojimus ar smegenų kamieno pažeidimus, tačiau tik tuo atveju, jei nėra trukdoma kontroliuoti. Pačios smegenėlės negali veikti taip, kaip smegenų kamienas.
Kai smegenų kamienas ir smegenėlės veikia normaliai, jie priklauso vienas nuo kito. Smegenų kamienas atlieka didžiausią įtaką abiejų organų atliekamoms funkcijoms. Smegenėlės veikia kaip struktūrinė atrama, padėdamos atlikti tas pačias funkcijas, kaip ir smegenų kamienas, bet ne iš to paties pajėgumo. Jei kyla problemų dėl kurio nors iš organų, tikėtina, kad bus paveikta motorinė kontrolė.