Taikomoji elgesio analizė yra viena iš dažniausiai naudojamų autizmo gydymo būdų; kai kurie įrodymai rodo, kad tai sėkmingas metodas. Pranešama, kad šis metodas yra veiksmingiausias, kai naudojamas tinkamai ir mažiausiai 36 valandas, bet pageidautina 40 valandų per savaitę. Dažnai teigiama, kad taikomoji elgesio analizė yra veiksminga gerinant socialinius įgūdžius, kalbos ir bendravimo įgūdžius, akademinius įgūdžius ir sumažinant pasikartojantį elgesį. Pranešama, kad šie rezultatai pagerino kai kurias emocines problemas, susijusias su autizmu. Taikomosios elgesio analizės kritikai teigia, kad norint, kad gydymas būtų veiksmingas, reikia ilgų valandų ir tinkamai apmokytų specialistų, o tai gali kainuoti brangiai.
Laikas, kurio reikia norint veiksmingai panaudoti taikomąją elgesio analizę autizmui gydyti, yra daug. Profesionalus terapeutas gali praleisti daugiau nei 40 valandų per savaitę su autizmu sergančiu pacientu. Dėl to tėvams kartais gali būti sunku rasti prieinamą terapeutą. Gali būti labai svarbu pasirinkti tinkamą terapeutą. Svarbu patikrinti nuorodas ir bet kurio kvalifikuoto terapeuto įgaliojimus, nes tokio gydymo veiksmingumas gali būti ne toks didelis be tinkamo mokymo.
Taikomoji autizmo elgesio analizė gali padėti pagerinti kalbos ir bendravimo įgūdžius, kai stebimas elgesys, o vėliau naudojami raginimai, padedantys pacientui bendrauti su kitais. Verbalinio elgesio metodai dažnai naudojami siekiant pagerinti kalbos sklandumą. Teisingas elgesys sustiprinamas apdovanojimais, kurie gali būti tokie maži kaip šypsena ar pagyrimai ir tokie dideli kaip fizinė atlygio sistema. Sklandumo ugdymo pratimai naudojami bendriems bendravimo įgūdžiams įgyti.
Pasikartojantis elgesys gali būti sumažintas naudojant taikomąją vaikų ir suaugusiųjų autizmo elgesio analizę. Terapeutas apdovanos norimą elgesį, ignoruodamas ir iš esmės neapdovanodamas pasikartojančio elgesio. Šio tipo terapija gali užtrukti savaites, o ne mėnesius, kad būtų atsižvelgta į bet kokius rezultatus. Kai kuriais atvejais gali prireikti metų, kol bus pastebėti teigiami rezultatai. Taikomoji elgesio analizė remiasi nuoseklumu; tai yra priežastis, dėl kurios norint pamatyti teigiamus rezultatus, dažnai prireikia daug gydymo valandų.
Kai kurie kritikai prieštarauja taikomosios autizmo elgesio analizės naudojimui. Jie gali manyti, kad tai per brangu daugeliui šeimų. Nors daugelis parduotuvių ir organizacijų remia šeimas, susiduriančias su autizmu, finansinė našta, reikalinga tokio tipo terapijai, kai kuriais atvejais gali būti didelė.