Šalutinis varfarino poveikis yra kraujavimas, nekrozė, kaulų tankio sumažėjimas ir purpurinio piršto sindromas. Šį šalutinį poveikį dažnai sukelia varfarino sąveika su įprastais vaistais ir kai kuriais maisto produktais. Šalutinis varfarino poveikis turi būti atidžiai stebimas, siekiant užtikrinti, kad jo dozė būtų tinkama ir saugi. Ankstyvosiose gydymo varfarinu stadijose gali prireikti kasdien tirti paciento kraują. Pagrindinis šio tyrimo tikslas yra užtikrinti, kad varfarinas nesukeltų paciento kraujavimo.
Kraujavimas yra vienas dažniausių varfarino šalutinių poveikių ir pasireiškia iki 2.7 proc. Prieš skirdamas varfariną, gydytojas visada turi pasverti naudą ir kraujavimo riziką. Konkretūs varfarino sukelto kraujavimo pavyzdžiai yra mėlynės, kraujo atkosėjimas, kraujavimas iš nosies ir kruvinas šlapimas. Kraujavimo rizika dar padidėja, kai varfarinas vartojamas kartu su nesteroidiniais vaistais nuo uždegimo ir vaistais nuo trombocitų. Hemodializuojamiems pacientams ir pagyvenusiems žmonėms, vartojant varfariną, padidėja kraujavimo rizika.
Nekrozė yra vienas iš retų varfarino šalutinių poveikių, kurie pirmiausia pažeidžia odą ir galūnes. Labiausiai tikėtina, kad tai pasireiškia pacientams, kuriems trūksta baltymo C – kito antikoagulianto, kuriam reikalingas vitaminas K. Varfarinas iš pradžių greičiau sumažina baltymo C kiekį kraujyje, nei sumažina krešėjimo faktorius. Tai gali sukelti didžiulius kraujo krešulius, kurie gali sukelti nekrozę ir gangreną. Pacientai, kuriems gresia varfarino nekrozė, paprastai vartoja hepariną kartu su varfarinu.
Kaulų tankio sumažėjimas, taip pat žinomas kaip osteoporozė, taip pat gali būti vienas iš šalutinių varfarino reiškinių. 1999 m. atliktas tyrimas, kuriame dalyvavo 572 varfariną vartojusios moterys, parodė, kad padaugėjo šonkaulių ir stuburo lūžių. Kitas 2006 m. atliktas tyrimas su vyrais siejo varfarino vartojimą mažiausiai vienerius metus su 60 % padidėjusia kaulų lūžių dėl osteoporozės rizika. Padidėjusi osteoporozės rizika dėl varfarino gali atsirasti dėl to, kad kai kuriems kaulų baltymams formuotis reikia vitamino K.
Purpurinio piršto sindromas yra vienas iš retų varfarino šalutinių poveikių. Pagrindinis simptomas yra mėlynos arba violetinės spalvos pakitimas, kuris labiausiai paveikia didįjį pirštą, tačiau gali atsirasti ir kitose pėdų dalyse. Purpurinio piršto sindromas paprastai pasireiškia per aštuonias savaites nuo gydymo varfarinu pradžios. Tikėtina purpurinio piršto sindromo priežastis yra cholesterolio nusėdimas pėdų odoje.