Skirtumas tarp bendros įmonės ir partnerystės daugiausia priklauso nuo finansinės, veiklos ir teisinės struktūros. Bendra įmonė yra situacija, kai du skirtingi ir nepriklausomi subjektai dirba kartu siekdami bendro tikslo. Nors kiekvienas darys nuolaidų ir padės kitam, jų finansai ir veikla išlieka atskiri, ir mažai tikėtina, kad jie bus atsakingi už kito ūkio subjekto skolas, nebent įmonės ribose. Partnerystėje du buvę nepriklausomi subjektai sujungia jėgas, kad sukurtų trečiąjį subjektą. Dėl to jų finansai ir veikla yra sujungti ir kiekvienas yra atsakingas už kito skolas ir veiksmus.
Vienas iš pagrindinių būdų atskirti bendrą įmonę ir partnerystę yra teisinė organizacija. Partnerystė yra juridinis asmuo, kuris paprastai yra įsteigtas pagal konkrečias valdymo taisykles ir yra įregistruotas valdymo organe. Norint gauti verslo liudijimą, dažnai reikia pateikti teisinius dokumentus, paaiškinančius bendrijos pobūdį. Bendrai įmonei, nors ją gali reglamentuoti šalių sutartis, nereikia teisinio pareiškimo ir daugeliu atvejų nereikia pateikti dokumentų.
Sąvokos „bendra įmonė“ ir „partnerystė“ taip pat reiškia labai skirtingas finansines ir veiklos struktūras. Partnerystėje subjektai susijungia, kad sudarytų vieną operacijų rinkinį ir praneša apie pajamas kaip vienas subjektas. Ūkio subjektas realizuoja pelną ir apmoka skolas.
Bendroje įmonėje sutarties sąlygos nusako, kokią pelno ir skolų dalį realizuos kiekviena šalis. Susitarime taip pat turėtų būti nurodyta kiekvienos šalies atsakomybė už operacijas. Mokesčius ir skolas mokės kiekviena šalis savarankiškai ir kiekviena bus atsakinga už savo įsipareigojimų vykdymą naudodama savo personalą ir vietą.
Daugeliu atvejų jungtinės įmonės ir partnerystės santykių trukmė skiriasi. Dauguma bendrų įmonių yra laikino pobūdžio. Jie gali trukti vos kelias dienas arba net metus, tačiau retai kada numatoma, kad jie truks bet kurio subjekto gyvenimą. Partnerystės pagal apibrėžimą sukuria subjektą ir todėl trunka visą subjekto gyvavimo laiką. Jei vienas iš partnerių nori pasitraukti, bendrija turi būti teisiškai nutraukta ir turi būti sudarytas naujas subjektas ar subjektai.
Svarbu pažymėti, kad bendra įmonė ir partnerystė skiriasi tik teisiniu požiūriu. Neįprasta, kad bendros įmonės nariai vienas kitą vadina partneriais arba praneša visuomenei, kad jie bendradarbiauja, kad pateiktų specialų pasiūlymą. Taip gali būti todėl, kad žodis „partneris“ paprastai turi šiltesnę, mažiau dalykišką konotaciją nei terminas „bendra įmonė“.