Skirtumas tarp biodyzelino ir biokuro yra tas, kad vienas yra kuras, o kitas yra kategorija: biodyzelinas yra viena iš biokuro rūšių. Biodegalai yra degalai, pagaminti iš kitų komponentų nei naftos produktai, pvz., alkoholio, metanolio, sojos ir daugybės kitų; biodyzelinas gaminamas iš augalinių aliejų. Šiai kategorijai priklauso daug įvairaus kuro – nuo malkų iki žmonių ir gyvūnų atliekų bei sąvartynų dūmų.
Naftos pagrindu pagaminto kuro kainoms kylant vis aukštyn ir kolektyviniam pasauliui sąmoningai linkstant ekologiškesniam gyvenimo būdui, vis daugiau žmonių kalba apie biodyzeliną ir kitus biokurus. Tačiau dėl šių terminų vis dar yra daug painiavos. Nors biodyzelinas yra palyginti nauja sąvoka, žmonės biokurą naudojo nuo tada, kai pirmieji urvų gyventojai išmoko gaminti maistą ir šildyti savo urvus atvira ugnimi. Biokurą geriausiai galima atpažinti kaip kurą, pagamintą iš pūvančių biologinių medžiagų, tokių kaip mediena ar šiukšlės, arba gyvuliniai ir augaliniai riebalai.
Nors biodyzelinas ir biodegalai kai kurioms šalims gali padėti sumažinti jų priklausomybę nuo naftos, tokie produktai kaip E-85 benzinas nėra biodegalai. Šiame gaminyje, be etanolio pagrindu pagamintų degalų, yra 15 % naftos benzino, todėl jis nepatenka į tą kategoriją. Kalbant apie tai, iškastinis kuras techniškai yra biokuras, nes jis gaminamas iš augalų ir gyvūnų, kurie mirė ir suiro per milijonus metų. Pagrindinis skirtumas yra tas, kad biokuras yra atsinaujinantis, o iškastinis kuras – ne.
Daugeliu atvejų biokuras pagamina daugiau energijos, nei reikia jiems pagaminti. Dėl to jie yra puikus atsinaujinančios energijos šaltinis, kuris gali būti gaminamas tik vienoje šalyje iš vietinių ūkininkų auginamų pasėlių ir gyvūnų. Ekologiniu požiūriu biodyzelinas ir kiti biodegalai degdami į atmosferą išskiria vidutiniškai 70 % mažiau anglies dvideginio, palyginti su dyzelinu.