Yra keletas skirtumų tarp S korporacijos ir C korporacijos, nors pagrindinis skirtumas yra būdas, kuriuo korporacija ir jos akcininkai moka mokesčius. AC korporacija iš esmės yra pagrindinė korporacija, turinti akcijų, akcininkų ir įmonės apsaugą nuo atsakomybės ieškinio ar kitų teisinių veiksmų atveju. Nors S korporacija turi tokią pačią apsaugą akcininkams, kuriems priklauso įmonė, tokio tipo įmonių akcininkai moka gyventojų pajamų mokestį, o korporacija ne. Šis dvigubo apmokestinimo panaikinimas yra pagrindinis skirtumas tarp S korporacijos ir C korporacijos.
Yra daug panašumų, kuriuos dalijasi S korporacija ir C korporacija. Abiejų tipų įmonės prasideda steigimo procedūromis, kurios leidžia nustatyti įmonės nuosavybę turint įmonės akcijas ar akcijas. S korporacija ir C korporacija taip pat užtikrina šių akcininkų apsaugą, todėl jie neturi jokios asmeninės atsakomybės įmonėje, išskyrus investicijas į akcijų ar akcijų pirkimą. Tai reiškia, kad jeigu tokiai bendrovei iškeliamas ieškinys, tai už teismo priteistą žalą ar kompensaciją atsako tik pati korporacija, kaip atskiras subjektas, o ne asmenys, kuriems ši korporacija priklauso.
Pagrindinis skirtumas tarp S korporacijos ir C korporacijos yra tai, kaip korporacija ir jos akcininkai moka pajamų mokesčius. AC korporacija iš esmės yra standartinė korporacija. Pasibaigus C korporacijos fiskaliniams metams, pati korporacija turi sumokėti mokesčius nuo pajamų ir pajamų. Individualūs C korporacijos akcininkai taip pat turi mokėti gyventojų pajamų mokesčius pagal pelną, kurį jie gavo kaip akcininkai korporacijoje, faktiškai du kartus sumokėdami mokestį nuo korporacijos pelno.
Kita vertus, S korporacija išvengia šio dvigubo apmokestinimo. Nors S korporacijos akcininkai vis dar moka asmeninius mokesčius, pati korporacija nemoka mokesčių pagal pajamas. Tai reiškia, kad S korporacijos akcininkai tik vieną kartą moka mokesčius už korporacijos gaunamas pajamas ir pelną, tačiau jiems vis tiek suteikiama asmeninė apsauga nuo atsakomybės už korporaciją. Kiti skirtumai tarp S korporacijos ir C korporacijos apima maksimalų korporacijos akcininkų skaičių, kuris yra ribojamas S korporacijoms, ir apribojimus, kas gali būti S korporacijos akcininku.