Nėra bendro sutarimo dėl pirmojo sudėtinio mikroskopo išradėjo. Dauguma valdžios institucijų mano, kad šį instrumentą išrado olandų akinių ir akinių gamintojas Zachariasas Janssenas Middleburge, Olandijoje apie 1595 m., kai kurie mano, kad jam padėjo jo tėvas Hansas Janssenas – jiedu dirbo kartu kurdami ir gamindami akinius. akiniai. Tačiau kai kurie kiti autoritetai mano, kad tame pačiame mieste gyvenantis vokietis Hansas Lippershey, taip pat akinių gamintojas, maždaug tuo pačiu metu išrado pirmąjį sudėtinį mikroskopą; nors jam priskiriama teleskopo išradimo nuopelnė, daug daugiau abejonių kyla dėl jo mikroskopo išradimo. Manoma, kad vienas kitą pažinoję Lippershey ir Janssenai prisidėjo prie abiejų instrumentų kūrimo idėjų.
Sudėtiniame mikroskope naudojami bent du atskiri lęšiai, užtikrinantys daug didesnį padidinimą, nei įmanoma naudojant tik vieną. Jį sudaro santykinai galingas objektyvas su trumpu židinio nuotoliu (vadinamu objektyvu) ir didesnis, bet mažiau galingas objektyvas su santykinai ilgu židinio nuotoliu, žinomas kaip okuliaras. Abu lęšiai paprastai yra sujungti vamzdeliu; tiriamas objektas dedamas po objektyvo lęšiu ir sufokusuojamas reguliuojant atstumą iki objekto.
Janssenai dėl savo profesijos būtų susipažinę su lęšių gamyba ir savybėmis, todėl manoma, kad pirmasis sudėtinis mikroskopas galėjo atsirasti dėl jų bandymų sukurti galingesnius akinius. Nė vienas iš ankstyviausių Jansenų instrumentų neišliko, tačiau pirmasis vis dar egzistuojantis sudėtinis mikroskopas yra matomas Middleburgo muziejuje ir, manoma, jį pagamino Janssenai. Jis nelabai primena šiuolaikinį mikroskopą su stovu, scena, ant kurios galima dėti pavyzdžius, ir keičiamais objektyvais, kad būtų galima atlikti įvairius padidinimus. Vietoj to, jis primena nedidelį teleskopą, nes susideda iš dviejų vamzdžių, kurių viename gale yra lęšis, laikomi šiek tiek platesniame vamzdyje, kad juos būtų galima perkelti atgal ir į priekį, kad būtų galima sufokusuoti dominantį objektą ir keisti padidinimą. . Nors šis mikroskopas buvo aiškiai sukurtas laikyti rankoje, yra nuorodų į kitą ankstyvą mikroskopą, kurį sukūrė Janssens, kuris stovėjo ant trikojo ir tikriausiai būtų panašus į šiuolaikinį instrumentą.
Ankstyviausias išlikęs sudėtinis mikroskopas galėjo padidinti objektus tik nuo maždaug trijų iki maždaug devynių kartų. Nepaisant to, jis veikė tais pačiais principais, kaip ir šiuolaikinis mikroskopas, ir atvėrė kelią instrumentų, kurie suteiktų daug didesnį padidinimą, kūrimui ir atvertų anksčiau nežinomą mikroskopinį pasaulį. Vėliau, XVII amžiuje, kitas olandų mokslininkas mėgėjas Antonas van Leeuwenhoekas savo sukurtus mikroskopus tyrinėjo mikroorganizmus vandens lašuose; Tačiau, nors ir galingesni už Jansenso sudėtinius mikroskopus, Leeuwenhoek’s turėjo tik vieną sferinį lęšį. Britų mokslininkas Robertas Hooke’as, Leeuwenhoek’o amžininkas, padarė keletą sudėtinio mikroskopo patobulinimų, kurie leido pasiekti daug didesnį padidinimą. Jo 17 m. darbas Micrographia dokumentuoja jo stebėjimus apie vabzdžius, ląsteles ir mikroorganizmus ir padėjo sukurti sudėtinį mikroskopą kaip esminį instrumentą mokslininkams.