Cheminis junginys yra molekulės tipas (sujungtų atomų rinkinys), sudarytas iš daugiau nei vieno elemento. Pavyzdžiui, vanduo (H2O) yra junginys, o dviatominis vandenilis (H2) nėra. Dauguma atomų, sudarančių Žemės plutą ir gyvus organizmus, yra sudėtinės formos. Junginiai pavaizduoti molekulinėmis formulėmis, kuriose išvardyti juos sudarantys atomai ir jų gausa.
Priklausomai nuo atomų, junginys gali būti laikomas skirtingomis cheminėmis jungtimis. Ryšiai susidaro sąveikaujant įvairių orbitų konfigūracijų atominiams elektronų apvalkalams. Priklausomai nuo elektronų, skriejančių aplink atomo branduolį, skaičiaus ir erdvės orbitose, tam tikri atomai yra linkę jungtis su tam tikrais kitų tipų atomais. Lewis taškai, grafinė sudėtinių jungčių tipų vaizdavimo sistema, pavadinta chemiko Gilberto Lewiso vardu, dažnai mokoma vidurinės mokyklos chemijos pamokose. Apie cheminių ryšių egzistavimą buvo spėliojama mažiausiai nuo XII amžiaus, nors visa sritis buvo menkai suprantama, kol 12 m. Lewisas neįvedė elektroninių ryšių sąvokos.
Kai atomas turi „pilną“ elektronų apvalkalą, jis yra labai nereaguojantis ir linkęs nesijungti su kitais atomais. Šiuos elementus galima rasti dešinėje periodinės lentelės pusėje ir jie vadinami tauriosiomis dujomis. Pavyzdžiui, helis, neonas ir argonas.
Cheminiuose junginiuose labiausiai paplitęs ryšys yra kovalentinis ryšys, kai abu juos sudarantys atomai turi panašų elektronegatyvumą, todėl elektronai pasiskirsto tolygiai. Elektronų orbitalės persidengia, o vienas elektronas gali skrieti aplink abu atomų branduolius, nepriklausydamas nei vienam, nei kitam. Molekulės, laikomos kovalentiniais ryšiais, pavyzdys yra deimantas. Antrasis jungties tipas, joninis ryšys, atsiranda atomuose, kurių elektronegatyvumas labai skiriasi, kai tas vienas atomas dominuoja tiekiant elektronus. Jie paprastai yra šiek tiek silpnesni nei kovalentiniai ryšiai. Pavyzdys yra natrio chloridas arba druska.
Yra ir kitų jungčių tipų: metalinės jungtys, van der Waals jėgos ir keletas kitų. Kartu jie sudaro visus cheminius junginius visatoje.