Fenolio ekstrahavimas yra mokslinis grynos ribonukleino rūgšties (RNR) ir dezoksiribonukleino rūgšties (DNR) ekstrahavimo iš konkretaus ląstelės mėginio procesas. Procesas daugiausia apima baltymų atskyrimą arba pašalinimą iš ląstelės, paliekant DNR ir RNR. Visame pasaulyje fenolio ekstrahavimas yra plačiausiai naudojamas grynų DNR ir RNR mėginių ekstrahavimo būdas.
Fenolio ekstrahavimo procesas prasideda, kai į ląstelės mėginį, kuris paprastai yra vandens mišinyje, įvedamas cheminis junginys fenolis. Kaip ir aliejaus, fenolio cheminė struktūra neleidžia jam lengvai susimaišyti su vandeniu, todėl jis nuslūgs tiesiai po vandeniu, nes fenolis yra tankesnis. Tada chemikai sumaišys dvi fazes – vandenį ir fenolį, kad laikinai sukurtų emulsiją.
Kol fenolis yra vandeniniame sluoksnyje, jis pritrauks ląstelės mėginio baltyminius elementus ir juos suskaidys. Tuo tarpu DNR arba RNR išliks nepažeista vandens fazėje. Tada viso mišinio talpykla bus patalpinta į mašiną, vadinamą centrifuga, kuri padės atskirti mišinį į dvi pradines fazes – fenolį ir vandenį. Kai mišinys bus atskirtas, chemikai išgautų vandenį, kuriame yra DNR arba RNR, o fenolio fazė pašalinama. DNR toliau nusodinama etanoliu, kad būtų pašalinta druska ir ji taptų labiau koncentruota.
DNR ekstrahavimui pasirenkamas fenolis, nes junginys yra nepolinė molekulė, o DNR ir vanduo susideda iš polinių molekulių. Chemijoje galioja bendra taisyklė, kad polinės molekulės geriausiai ištirpsta polinėse molekulėse, o nepolinės molekulės gali lengvai ištirpinti nepolines molekules. Tai reiškia, kad nors fenolis ištirpdo baltymą fenolio ekstrakcijos metu, jis neištirps DNR ar RNR, todėl jie išlaiko savo struktūrą ir gali būti išgaunami iš vandens. Fenolis taip efektyviai tirpdo baltymus, kad pastarieji bus visam laikui suskaidyti.
Ekstrahuojant fenolį, viso mišinio rūgštingumas yra svarbus norint efektyviai išgauti DNR ir RNR. Chemikai rekomenduoja, kad fenolio pH būtų didesnis nei 7, kad vandens sluoksnis galėtų sėkmingai surinkti DNR. Esant 4.5 pH, kuris jau laikomas rūgštiniu, RNR jau gali surinkti vandens fazė. Norint pakeisti fenolio rūgštingumą ar šarmingumą, pridedama kai kurių cheminių medžiagų, tokių kaip junginys tris arba N-etilmorfolinas.