Fluoroforas yra molekulės dalis, atsakinga už fluorescencinės spinduliuotės sukūrimą matomos šviesos spektre. Fluoroforai, žinomi kaip chromoforai, sugeria skirtingų bangų ilgių šviesą, sukurdami matomą šviesą. Iš esmės tai yra sritis, kurioje yra dviejų skirtingų molekulių elektronų orbitos. Šviesa veikia šią sritį ir sužadina elektronus, kad sukurtų šviesą. Fluoroforo atveju tai sukelia mažiau energingo bangos ilgio stimuliavimą.
Fluoroforo spektras sugeria fotonus, tačiau vietoj to, kad elektrono viduje būtų sukurtas didesnis susijaudinimas, jis sukuria mažesnį greitį. Dėl to susidaro ryškūs vaizdai, paprastai susiję su fluorescencija. Iš esmės kuo ryškesnė ekspozicijos šviesa, tuo mažiau matoma fluorescencija. Dėl šios priežasties daugelis fluorescencinių spalvų geriausiai matomos šviesos šaltiniuose, tokiuose kaip juodos šviesos.
Fluoroforai gali egzistuoti natūraliai arba įvedami dirbtiniais metodais. Daugelis žuvų ir uolų palaiko natūralų šio chromoforo lygį. Tačiau jis yra labiausiai paplitęs mokslo bendruomenėje, kai naudojamas tyrimams. Jis padeda analizuoti tam tikras medžiagų savybes, leidžia tyrėjams nustatyti reakcijas ir pokyčius biochemijos ir baltymų tyrimo srityse. Pavyzdžiui, imunofluorescencijos disciplina naudoja techniką, padedančią žymėti antigenus ir antikūnus tarpląsteliniame lygmenyje.
Dažniausiai moksliniuose tyrimuose naudojamas fluoroforas yra fluoresceino izotiocianatas – medžiaga, kuri gali būti chemiškai prijungta prie molekulių. Tai suteikia mokslininkams būdą vizualizuoti nefluorescencinių medžiagų pokyčius. Kiti pavyzdžiai yra kumarinas, cianinas ir rodaminas. Tam tikros medžiagos, naudojančios fluorescenciją, gali turėti neigiamą poveikį tyrimams dėl pH lygio pokyčių. Vykstant tyrimams, kuriami nauji dažai, kurių kiekvienas turi skirtingą pritaikymą, leidžiantį mažiau įkyrių molekulių pokyčių.
Be gryno mokslo, fluoroforo modifikavimas tapo populiariu būdu parduoti produktus vartotojams. Vienas iš pagrindinių pavyzdžių yra GloFish™, genetiškai modifikuota zebražuvė, kurią galima įsigyti raudonos, žalios arba oranžinės fluorescencinės spalvos. 1999 m. Singapūro nacionalinio universiteto mokslininkai bandė sukurti žuvį, kuri galėtų aptikti taršą. Sujungus žalią fluorescencinį medūzos baltymą su zebrafiu, gyvūnas pasižymėjo ryškia fluorescencija, ypač esant juodai šviesai. Netrukus buvo atrasta, kad papildomi atributai iš kitų šaltinių, pavyzdžiui, jūros koralai, gali būti naudojami kuriant naujas spalvas, atveriant kelią gyviems fluorescenciniams gyvūnams, kuriuos galima parduoti kaip augintinius.