Jungtinėse Amerikos Valstijose Nacionalinė gyvūnų identifikavimo sistema yra programa, skirta stebėti daugybę skirtingų gyvūnų, kai kurie yra skirti parduoti maistui, o kiti ne. Griežtai kalbant, programa yra savanoriška. Tačiau daugelis vyriausybinių programų ir kai kurių rūšių parama ūkiams yra susieta su dalyvavimu programoje, todėl gyvulių augintojams sunku tam tikru momentu neįsitraukti.
Pagrindinis Nacionalinės gyvūnų identifikavimo sistemos tikslas – suteikti galimybę atsekti gyvūnus ligos protrūkio atveju. Tokiais atvejais nustatyti, iš kur gyvūnai kilę, gali būti labai svarbu nustatyti, kokie kiti gyvūnai gali būti paveikti. Kai kuriais atvejais tai gali paveikti visą maisto tiekimą.
Kai įvyksta ligos protrūkis, sveikatos apsaugos pareigūnai turi žinoti tris svarbias informacijos dalis. Pirma, kurie gyvūnai buvo užsikrėtę arba dalyvavo protrūkyje. Antrasis – tų užsikrėtusių gyvūnų vieta. Trečia – kokie kiti gyvūnai galėjo susirgti šia liga. Nacionalinė gyvūnų identifikavimo sistema padėtų nustatyti visas tris šias informacijos dalis.
Viena iš pagrindinių Nacionalinės gyvūnų identifikavimo sistemos savybių yra gyvūnų sekimas sistemoje. Kai gyvūnas parduodamas ar perkeliamas, Nacionalinė gyvūnų identifikavimo sistema pažymi šį faktą. Tam tikru momentu ši informacija gali būti naudojama ženklinant, kad visi vartotojai žinotų, kur ir kuriame proceso etape buvo mėsa, tiek gyva, tiek po skerdimo.
Nacionalinės gyvūnų identifikavimo sistemos kritika sutelkta į gyvūnų, kuriuos reikia sekti, tipus ir suvokiamą dvigubą standartą tarp įmonių ūkių ir mažesnių šeimos ūkių. Dalyvaujantiems gali tekti pažymėti visus ūkio gyvūnus. Tačiau didesni ūkiai gali identifikuoti savo gyvulius kaip visumą, o ne po vieną, o tai gali suteikti jiems pranašumą. Be to, visi dideli ūkiniai gyvūnai, net ir nenaudojami maistui, turėtų būti įtraukti į programą, o tai padidins programos išlaidas.
Be to, tie, kurie priešinasi Nacionalinei gyvūnų identifikavimo sistemai, teigia, kad tai tik padidins maisto išlaidas ir vyriausybės biurokratiją. Nors tai gali padaryti maisto sistemą saugesnę, mokesčiai, susiję su kiekvieno gyvūno identifikavimu, bus perduoti vartotojui, sako kritikai. Jie tvirtina, kad tai tik pakenks JAV maisto pramonei ir apsunkins konkurenciją užsienyje. Tačiau kai kuriose užsienio rinkose reikalaujama identifikavimo sistemos, kurioje būtų išsamiai aprašytas kiekvienas veiksmas, nes baiminasi galvijų spongiforminio encefalito, žinomo kaip karvių proto liga, ir kitų įprastų gyvūnų ligų.