Mikrobangų krosnelės yra sudėtingos mašinos, ir nors daugelis žmonių yra susipažinę su lengvai pastebimomis mikrobangų krosnelės dalimis, tokiomis kaip klavišų skydelis, maitinimo laidas, patefonas ir kepimo ertmė, viduje yra integruotos mikrobangų krosnelės dalys, kurias retai kada mato. Iš esmės mikrobangų krosnelės vidus yra padalintas į dvi dalis, būtent valdymo sekciją ir aukštos įtampos sekciją. Valdymo skyriuje yra laikmatis, energijos išvesties valdikliai, blokavimo jungiklių ir saugos įtaisų serija. Aukštos įtampos skyriuje yra aukštos įtampos transformatorius, diodas ir kondensatorius, bangų kreiptuvas ir maišyklės mentė.
Mikrobangų krosnelės klavišų skydelis paprastai yra priekyje ir yra sritis, kurioje vartotojai įves gaminimo laiką ir norimą energijos lygį. Maitinimo laidas yra tiesiog ta dalis, kuri jungiama į sieninį lizdą. Kepimo ertmė yra mikrobangų krosnelės erdvė, kurioje dedamas maistas. Sukamasis stalas yra kepimo ertmėje esanti platforma, kuri daugelyje mikrobangų krosnelių modelių sukasi gaminant maistą.
Valdymo skyriuje yra kelios mikrobangų krosnelės dalys, kurios reguliuoja energijos išeigą. Laikmatis, kuris yra susietas su klaviatūra, turi keletą blokuojančių grandinių, kurios stebi signalų, siunčiamų į dalis, kurios teikia įtampą ir generuoja mikrobangas, dažnį. Daugumoje mikrobangų krosnelių šalia durų yra du blokuojami saugos jungikliai, kurie nutraukia mikrobangų energijos gamybą, kai durys yra atidarytos. Įvairūs saugikliai ir šiluminės apsaugos yra valdymo skyriuje ir tarnauja kaip avarinio išjungimo mechanizmai perkaitimo ar elektros problemų atveju. Triac, elektromagnetinės relės jungiklis, sukuriantis įtampos kelią, kai mikrobangų krosnelė yra paruošta gaminti, taip pat yra valdymo skyriaus dalis.
Prietaiso aukštos įtampos srityje yra dalių, kurios sukuria mikrobangų krosneles. Transformatorius yra neatskiriama dalis, nes perduoda įtampą iš buitinio lizdo į diodą ir kondensatorių. Diodas ir kondensatorius yra mikrobangų dalys, kurios padidina įtampą iki 3,000–5,000 voltų, priklausomai nuo modelio. Padidėjusi įtampa perkeliama į dalį, vadinamą magnetroniniu vamzdžiu, kuri įtampą paverčia mikrobangomis.
Sukūrus mikrobangų krosneles, jos perduodamos į metalinį kanalą, vadinamą bangolaidžiu. Bangolaidis tiekia energiją į virimo ertmę. Ertmėje yra dalis, vadinama maišyklės ašmenimis, kuri lėtai sukasi, kad mikrobangos tolygiai paskirstytų viduje. Dauguma mikrobangų krosnelių turi specialius metalinius ekranus ant durų langų ir metalines dangas išilgai sienų, kad mikrobangos šokinėtų aplink vidų ir prasiskverbtų į maistą iš visų pusių.
Kitos mikrobangų krosnelės dalys yra ertmės lempa ir pūstuvo variklis. Ertminė lempa yra maža lemputė, apšviečianti ertmės vidų. Pūstuvo variklis yra mažas ventiliatorius, kuris neleidžia prietaisui perkaisti, kai jis veikia. Mikrobangų krosnelės būna įvairių stilių ir dydžių, o konkrečios dalys ir jų vietos skiriasi.